Eksotoksiner (fra det latinske Exo - utenfor, Toxicum - gift) er ekstremt sterke giftstoffer som skilles ut av bakterieceller til deres miljø. Disse giftstoffene er hovedårsaken til ulike bakterielle infeksjoner hos mennesker og dyr, og kan forårsake alvorlige sykdommer som antrasitt, botulisme, difteri, stafylokokkseptikemi og andre.
Eksotoksiner kan forårsake alvorlige reaksjoner i kroppen, slik som celleskade, metabolske forstyrrelser og til og med stans av indre organer. De påvirker ulike systemer i kroppen, inkludert nerve-, immun- og kardiovaskulære systemer, noe som kan føre til alvorlige komplikasjoner og til og med død.
Frigjøring av eksotoksiner er en av hovedmekanismene for bakteriell infeksjon. De kan frigjøres både under veksten av bakterier og etter at de dør, noe som gjør at de kan forbli i miljøet i lang tid. Dette gjør eksotoksiner spesielt farlige fordi de kan fortsette å påvirke organismer selv etter at smittekilden er ødelagt.
De fleste eksotoksiner er proteiner som kan være svært forskjellige i struktur og funksjon. Noen eksotoksiner kan forårsake katastrofale effekter selv ved svært lave konsentrasjoner, så selv små mengder av disse giftstoffene kan være farlige for mennesker.
Kampen mot bakterielle infeksjoner forårsaket av eksotoksiner er basert på bruk av antibiotika og andre antimikrobielle midler. Noen bakterier kan imidlertid utvikle resistens mot slike legemidler, noe som gjør dem vanskeligere å behandle. Derfor er effektiv forebygging og kontroll av bakterielle infeksjoner viktige tiltak som må iverksettes for å forebygge sykdommer forårsaket av eksotoksiner.