Escherichia coli е името, дадено на бактериите, които са част от чревната микрофлора на хората и животните, а също така съставляват значителна част от човешката микробиота, ако я разглеждаме като цяло, дори без да даваме предпочитание на определена област - за например устната кухина. Но в същото време повечето патогенни форми имат очевидни разлики с нормалния щам на Е. coli и могат значително да се различават от „полезната“ пръчка по отношение на размера, структурните характеристики и ензимните свойства, които определят характеристиките на метаболизма и биохимичните реакцията на микроорганизмите към външни фактори. Просто казано, E. coli при хора или животни играе изключително важна роля, действайки като допълнителен елемент на имунната защита на организма. Но опортюнистични видове са замесени в много сериозни заболявания.