Escherichia coli er navnet på bakterier, der er en del af tarmmikrofloraen hos mennesker og dyr, og som også udgør en væsentlig del af den menneskelige mikrobiota, hvis vi betragter det som en helhed, selv uden at give præference til et specifikt område - f.eks. for eksempel mundhulen. Men samtidig har de fleste patogene former åbenlyse forskelle med den normale stamme af E. coli og kan adskille sig væsentligt fra den "nyttige" stang med hensyn til størrelse, strukturelle egenskaber og enzymatiske egenskaber, som bestemmer karakteristikaene for stofskiftet og biokemiske mikroorganismers reaktion på eksterne faktorer. Kort sagt, E. coli hos mennesker eller dyr spiller en ekstremt vigtig rolle, idet den fungerer som et ekstra element i kroppens immunforsvar. Men opportunistiske arter er involveret i mange alvorlige sygdomme.