Polydeoxyribonukleotid syntetáza

Polydeoxyribonukleotid syntetáza (PDS, anglicky Polynukleotid ligase) je enzym, který se podílí na syntéze nukleových kyselin. PDS hraje důležitou roli v replikaci DNA a dalších procesech spojených se syntézou nukleových kyselin.

PDS je jedním z klíčových enzymů syntézy DNA. Používá se k připojení nukleotidů k ​​rostoucímu řetězci DNA, čímž se vytvářejí nové řetězce DNA. K tomu dochází navázáním dvou nukleotidových zbytků, které jsou následně spojeny dohromady. PDS se také podílí na opravě poškozené DNA, což pomáhá předcházet poškození genetického materiálu buňky.

Kromě toho se PDS podílí na syntéze RNA, syntetizuje nové molekuly RNA na základě existujících nukleotidových řetězců. Je důležitý pro mnoho biologických procesů, jako je syntéza proteinů a genová regulace.

Obecně je PDS klíčovým enzymem při syntéze a redukci nukleových kyselin a hraje důležitou roli v mnoha biologických procesech.

Co je to polynukleosidová fosfodiethyláza (PDN-A) a jaká je její úloha v přírodě Polynukleosidová fosfodiethyláza (PDNA) je enzym, který hraje důležitou roli při replikaci a opravě DNA. Je to klíčový enzym v procesu skládání nukleotidů. Za účasti tohoto enzymu je syntetizována jedna z hlavních složek DNA - polynukleofilní sekvence ("polymer"), která se skládá dohromady. Polynukleofobní sekvence a molekuly, které dokončují tvorbu vláken, jsou enzymy, které se následně nazývají primery. Proces replikace je pro nebiology velmi obtížně pochopitelný. Právě deoxyuridinový primer dokončuje stavbu řetězce DNA pomocí RNA templátu, který se skládá z jednoho vlákna. Poté začnou pracovat zbytek enzymů. Polymeráza zabudovává nový řetězec pomocí „jehly“, která se skládá z nukleotrimethinových vazeb. Plní funkci odtlačování nití od sebe. Výsledkem je vytvoření dvouvlákna DNA. S touto strukturou jsou tyto molekuly připraveny ke zkopírování. Po replikaci jsou obě vlákna oddělena. Tento proces je rozdělen do dvou fází: iniciace a elongace. Iniciace je spojena s připojením volné DNA polymerázy 2 na DNA a vznikem obou polymerů na jejím základě. K prodloužení DNA dochází prodlužováním řetězce bez templátu. Když je však délka řetězců velká (více než 59 nukleotidových vazeb), je nutné je „protlačit“ oblastmi buňky. To vyžaduje speciální enzym – PDN-A. Aktivuje první kontakty replikonu s párovými řetězci v důsledku prasknutí alkoholové skupiny (snížení reaktivity) a připojení polymerázy I. Poté na něj začne působit další enzym (replikace enzymového řetězce). Poté, co dokončí 7-8 cyklů provozu, chemicky změní strukturu řetězce a nahradí jím zbytky cyklického dimesolu. Jsou syntetizovány speciální enzymy (fragmentoly), které vazbu „přerušují“ (5´─5`-likvidátory) a tvoří zlomy. V posledních fázích dochází k vytváření jednotlivých článků a vláken. Některé fosfodiesterázy obsahující nukleotidy (včetně serózních) hrají stejnou roli. Funkcí PDNA je zajistit izomerizaci dimeru pyronukleázy (zajistit syntézu polynukleolinosiniového vlákna) na laktamázu dihydropyridrinázu. Dochází k tvorbě blastimidolyfu. Fenoltvorný komplex včetně jeho metabolitů (pyrofosfát, hydroxyfenanthridioniumhydrazin) je chráněn před přímou destrukcí aminofenolázami komplexu (ADP-alanin difos