Polydeoxyribonucleotide synthetase (PDS, Engels Polynucleotide ligase) is een enzym dat betrokken is bij de synthese van nucleïnezuren. PDS speelt een belangrijke rol bij DNA-replicatie en andere processen die verband houden met de synthese van nucleïnezuren.
PDS is een van de belangrijkste enzymen bij de DNA-synthese. Het wordt gebruikt om nucleotiden aan een groeiende DNA-streng te hechten, waardoor nieuwe DNA-strengen ontstaan. Dit gebeurt door de binding van twee nucleotideresten, die vervolgens met elkaar worden verbonden. PDS is ook betrokken bij het repareren van beschadigd DNA, waardoor schade aan het genetische materiaal van de cel wordt voorkomen.
Bovendien is PDS betrokken bij de RNA-synthese, waarbij nieuwe RNA-moleculen worden gesynthetiseerd op basis van bestaande nucleotideketens. Het is belangrijk voor veel biologische processen zoals eiwitsynthese en genregulatie.
Over het algemeen is PDS een sleutelenzym bij de synthese en reductie van nucleïnezuren en speelt het een belangrijke rol in veel biologische processen.
Wat is polynucleoside fosfodiethylase (PDN-A) en wat is de rol ervan in de natuur Polynucleoside fosfodiethylase (PDNA) is een enzym dat een belangrijke rol speelt bij DNA-replicatie en -reparatie. Het is een sleutelenzym in het proces van nucleotidevouwing. Met de deelname van dit enzym wordt een van de belangrijkste componenten van DNA gesynthetiseerd: een polynucleofiele sequentie ("polymeer"), die samenvouwt. De polynucleofobe sequentie en moleculen die de vorming van de strengen voltooien, zijn de enzymen die vervolgens primers worden genoemd. Het replicatieproces is voor niet-biologen erg moeilijk te begrijpen. Het is de deoxyuridine-primer die de constructie van de DNA-keten voltooit met behulp van de RNA-sjabloon, die uit een enkele streng bestaat. Dan beginnen de rest van de enzymen te werken. Het polymerase neemt een nieuwe keten op met behulp van een “naald” die bestaat uit nucleotrimethinebindingen. Ze vervullen de functie van het van elkaar af duwen van de draden. Als gevolg hiervan wordt een dubbele DNA-streng gevormd. Met deze structuur zijn deze moleculen klaar om gekopieerd te worden. Na replicatie worden beide strengen gescheiden. Dit proces is verdeeld in twee fasen: initiatie en verlenging. Initiatie is geassocieerd met de hechting van vrij DNA-polymerase 2 aan DNA en de vorming van beide polymeren op basis daarvan. DNA-verlenging vindt plaats door de keten zonder sjabloon te verlengen. Wanneer de lengte van de ketens echter groot is (meer dan 59 nucleotidebindingen), is het noodzakelijk om ze door delen van de cel te ‘duwen’. Hiervoor is een speciaal enzym nodig: PDN-A. Het activeert de eerste contacten van het replicon met gepaarde ketens als gevolg van het scheuren van de alcoholgroep (verminderde reactiviteit) en de aanhechting van polymerase I. Vervolgens begint het volgende enzym erop in te werken (replicatie van de enzymketen). Nadat het 7-8 werkingscycli heeft voltooid, verandert het op chemische wijze de structuur van de keten en vervangt het de overblijfselen van cyclisch dimesol ermee. Er worden speciale enzymen (fragmentolen) gesynthetiseerd die de binding “verbreken” (5´─5`-liquidatoren) en breuken vormen. In de laatste fasen vindt de vorming van individuele links en threads plaats. Sommige nucleotide-bevattende fosfodiësterasen (inclusief sereuze) spelen dezelfde rol. De functie van PDNA is het verzekeren van de isomerisatie van het pyronucleasedimeer (om de synthese van de polynucleolinosiniumstreng te verzekeren) tot lactamasedihydropyridrinase. De vorming van blastimidolyph vindt plaats. Het fenolvormende complex, inclusief zijn metabolieten (pyrofosfaat, hydroxyfenanthridioniumhydrazine), wordt beschermd tegen directe vernietiging door aminofenolasen van het complex (ADP-alaninedifos