Πολυδεοξυριβονουκλεοτιδική συνθετάση

Η συνθετάση πολυδεοξυριβονουκλεοτιδίου (PDS, αγγλική πολυνουκλεοτιδική λιγάση) είναι ένα ένζυμο που εμπλέκεται στη σύνθεση νουκλεϊκών οξέων. Το PDS παίζει σημαντικό ρόλο στην αντιγραφή του DNA και σε άλλες διαδικασίες που σχετίζονται με τη σύνθεση νουκλεϊκών οξέων.

Το PDS είναι ένα από τα βασικά ένζυμα στη σύνθεση του DNA. Χρησιμοποιείται για τη σύνδεση νουκλεοτιδίων σε έναν αναπτυσσόμενο κλώνο DNA, δημιουργώντας νέους κλώνους DNA. Αυτό συμβαίνει με τη σύνδεση δύο υπολειμμάτων νουκλεοτιδίων, τα οποία στη συνέχεια ενώνονται μεταξύ τους. Το PDS εμπλέκεται επίσης στην επιδιόρθωση του κατεστραμμένου DNA, το οποίο βοηθά στην πρόληψη της βλάβης στο γενετικό υλικό του κυττάρου.

Επιπλέον, το PDS εμπλέκεται στη σύνθεση RNA, συνθέτοντας νέα μόρια RNA με βάση τις υπάρχουσες αλυσίδες νουκλεοτιδίων. Είναι σημαντικό για πολλές βιολογικές διεργασίες όπως η πρωτεϊνοσύνθεση και η γονιδιακή ρύθμιση.

Γενικά, το PDS είναι ένα βασικό ένζυμο στη σύνθεση και τη μείωση των νουκλεϊκών οξέων και παίζει σημαντικό ρόλο σε πολλές βιολογικές διεργασίες.

Τι είναι η πολυνουκλεοσιδική φωσφοδιαιθυλάση (PDN-A) και ποιος είναι ο ρόλος της στη φύση Η πολυνουκλεοσιδική φωσφοδιεθάση (PDNA) είναι ένα ένζυμο που παίζει σημαντικό ρόλο στην αντιγραφή και επιδιόρθωση του DNA. Είναι ένα βασικό ένζυμο στη διαδικασία αναδίπλωσης νουκλεοτιδίων. Με τη συμμετοχή αυτού του ενζύμου, συντίθεται ένα από τα κύρια συστατικά του DNA - μια πολυπυρηνόφιλη αλληλουχία ("πολυμερές"), η οποία διπλώνει μαζί. Η πολυπυρηνοφοβική αλληλουχία και τα μόρια που ολοκληρώνουν το σχηματισμό των κλώνων είναι τα ένζυμα που στη συνέχεια ονομάζονται εκκινητές. Η διαδικασία αντιγραφής είναι πολύ δύσκολη για τους μη βιολόγους να κατανοήσουν. Είναι ο εκκινητής δεοξυουριδίνης που ολοκληρώνει την κατασκευή της αλυσίδας του DNA χρησιμοποιώντας το πρότυπο RNA, το οποίο αποτελείται από έναν μόνο κλώνο. Στη συνέχεια αρχίζουν να λειτουργούν τα υπόλοιπα ένζυμα. Η πολυμεράση ενσωματώνει μια νέα αλυσίδα χρησιμοποιώντας μια «βελόνα» που αποτελείται από δεσμούς νουκλεοτριμεθίνης. Εκτελούν τη λειτουργία της ώθησης των νημάτων μακριά το ένα από το άλλο. Ως αποτέλεσμα, σχηματίζεται ένας διπλός κλώνος DNA. Με αυτή τη δομή, αυτά τα μόρια είναι έτοιμα για αντιγραφή. Μετά την αντιγραφή, και οι δύο κλώνοι διαχωρίζονται. Αυτή η διαδικασία χωρίζεται σε δύο φάσεις: έναρξη και επιμήκυνση. Η έναρξη σχετίζεται με την προσκόλληση της ελεύθερης πολυμεράσης DNA 2 στο DNA και το σχηματισμό και των δύο πολυμερών στη βάση του. Η επιμήκυνση του DNA συμβαίνει με την επέκταση της αλυσίδας χωρίς μήτρα. Ωστόσο, όταν το μήκος των αλυσίδων είναι μεγάλο (περισσότεροι από 59 δεσμοί νουκλεοτιδίων), είναι απαραίτητο να τις «σπρώξουμε» μέσα από περιοχές του κυττάρου. Αυτό απαιτεί ένα ειδικό ένζυμο - PDN-A. Ενεργοποιεί τις πρώτες επαφές του αντιγράφου με ζευγαρωμένες αλυσίδες λόγω της ρήξης της ομάδας αλκοόλης (μειωμένη αντιδραστικότητα) και της προσκόλλησης της πολυμεράσης Ι. Στη συνέχεια το επόμενο ένζυμο αρχίζει να δρα πάνω του (αντιγραφή της ενζυμικής αλυσίδας). Αφού ολοκληρώσει 7-8 κύκλους λειτουργίας, αλλάζει χημικά τη δομή της αλυσίδας και αντικαθιστά με αυτήν τα υπολείμματα κυκλικής διμεζόλης. Συντίθενται ειδικά ένζυμα (fragmentols) που «κόβουν» τον δεσμό (5´─5»-εκκαθαριστές) και σχηματίζουν θραύσματα. Στα τελευταία στάδια, εμφανίζεται ο σχηματισμός μεμονωμένων συνδέσμων και νημάτων. Ορισμένες φωσφοδιεστεράσες που περιέχουν νουκλεοτίδια (συμπεριλαμβανομένων των ορωδών) παίζουν τον ίδιο ρόλο. Η λειτουργία του PDNA είναι να εξασφαλίσει τον ισομερισμό του διμερούς πυρονουκλεάσης (για να εξασφαλίσει τη σύνθεση του κλώνου πολυνουκλεολινοσινίου) σε διυδροπυριδρινάση λακταμάσης. Εμφανίζεται ο σχηματισμός βλαστιμιδόλυφου. Το σύμπλοκο που σχηματίζει φαινόλη, συμπεριλαμβανομένων των μεταβολιτών του (πυροφωσφορικό, υδροξυφαινανθριδόνιο υδραζίνη), προστατεύεται από την άμεση καταστροφή από τις αμινοφαινολάσες του συμπλόκου (ADP-alanine diphos