Syntetaza polideoksyrybonukleotydowa

Syntetaza polideoksyrybonukleotydowa (PDS, angielska ligaza polinukleotydowa) to enzym biorący udział w syntezie kwasów nukleinowych. PDS odgrywa ważną rolę w replikacji DNA i innych procesach związanych z syntezą kwasów nukleinowych.

PDS jest jednym z kluczowych enzymów w syntezie DNA. Służy do przyłączania nukleotydów do rosnącej nici DNA, tworząc nowe nici DNA. Dzieje się to poprzez wiązanie dwóch reszt nukleotydowych, które następnie są łączone ze sobą. PDS bierze również udział w naprawie uszkodzonego DNA, co pomaga zapobiegać uszkodzeniom materiału genetycznego komórki.

Ponadto PDS bierze udział w syntezie RNA, syntetyzując nowe cząsteczki RNA w oparciu o istniejące łańcuchy nukleotydowe. Jest ważny dla wielu procesów biologicznych, takich jak synteza białek i regulacja genów.

Ogólnie rzecz biorąc, PDS jest kluczowym enzymem w syntezie i redukcji kwasów nukleinowych i odgrywa ważną rolę w wielu procesach biologicznych.

Co to jest fosfodietaza polinukleozydowa (PDN-A) i jaka jest jej rola w przyrodzie Fosfodiestaza polinukleozydowa (PDNA) jest enzymem odgrywającym ważną rolę w replikacji i naprawie DNA. Jest kluczowym enzymem w procesie zwijania nukleotydów. Przy udziale tego enzymu syntetyzowany jest jeden z głównych składników DNA - sekwencja polinukleofilowa („polimer”), która się składa. Sekwencja polinukleofobowa i cząsteczki, które kończą tworzenie nici, to enzymy zwane później starterami. Proces replikacji jest bardzo trudny do zrozumienia dla osób niebędących biologami. To starter dezoksyurydynowy uzupełnia konstrukcję łańcucha DNA z wykorzystaniem matrycy RNA, która składa się z pojedynczej nici. Wtedy zaczynają działać pozostałe enzymy. Polimeraza zawiera nowy łańcuch za pomocą „igły”, która składa się z wiązań nukleotrimetynowych. Pełnią funkcję odpychania nitek od siebie. W rezultacie powstaje podwójna nić DNA. Dzięki tej strukturze cząsteczki te są gotowe do skopiowania. Po replikacji obie nici zostają rozdzielone. Proces ten dzieli się na dwie fazy: inicjację i elongację. Inicjacja wiąże się z przyłączeniem wolnej polimerazy DNA 2 do DNA i utworzeniem na jej bazie obu polimerów. Wydłużenie DNA następuje poprzez wydłużenie łańcucha bez matrycy. Jeżeli jednak długość łańcuchów jest duża (ponad 59 wiązań nukleotydowych), konieczne jest „przepchnięcie” ich przez obszary komórki. Wymaga to specjalnego enzymu – PDN-A. Aktywuje pierwsze kontakty replikonu ze sparowanymi łańcuchami w wyniku zerwania grupy alkoholowej (zmniejszona reaktywność) i przyłączenia polimerazy I. Wtedy zaczyna na nią oddziaływać kolejny enzym (replikacja łańcucha enzymatycznego). Po wykonaniu 7-8 cykli działania zmienia chemicznie strukturę łańcucha i zastępuje nim pozostałości cyklicznego dimezolu. Syntetyzowane są specjalne enzymy (fragmentole), które „przecinają” wiązanie (5'─5'-likwidatory) i tworzą pęknięcia. Na ostatnich etapach następuje tworzenie poszczególnych ogniw i wątków. Tę samą rolę odgrywają niektóre fosfodiesterazy zawierające nukleotydy (w tym surowicze). Funkcją PDNA jest zapewnienie izomeryzacji dimeru pironukleazy (w celu zapewnienia syntezy nici polinukleolinozynowej) do dihydropiryrynazy laktamazy. Następuje powstawanie blastymidolifu. Kompleks tworzący fenol, w tym jego metabolity (pirofosforan, hydrazyna hydroksyfenantridionium), jest chroniony przed bezpośrednim zniszczeniem przez aminofenolazy kompleksu (ADP-alanina difos