Σύμφωνα με τον P.K. Anokhin, τα κύρια ενδιάμεσα κέντρα του MCP εντοπίζονται στους εγκεφαλικούς μίσχους. Ένα χαρακτηριστικό αυτού του τμήματος του συστήματος είναι η διέλευση των προσαγωγών διεγερτικών μονοπατιών από τους υποδοχείς των εσωτερικών οργάνων στον πυρήνα του XII ζεύγους των κρανιακών νεύρων και η σύνδεσή του με το νωτιαίο μυελό. Ο τοξοειδής πυρήνας (λατ. nucleus arcuatus) γειτνιάζει απευθείας με τον άνω επίμηκες πυρήνα. Η προκύπτουσα τροχιά που συνδέει τους πυρήνες της έσω διαμήκους περιτονίας με τα οπίσθια κέρατα III