Ruchy oddechowe, które rozszerzają i kurczą klatkę piersiową, są kontrolowane przez rdzeń przedłużony, część mózgu zlokalizowaną z tyłu czaszki, gdzie zaczyna się rdzeń kręgowy. Rdzeń kręgowy składa się z komórek i włókien nerwowych, które przekazują polecenia do przepony i mięśni międzyżebrowych, powodując kurczenie się lub rozluźnianie włókien mięśniowych.
W rdzeniu przedłużonym znajdują się dwa ośrodki kontroli oddechowej, które działają w sposób skoordynowany: jeden określa, czy we krwi jest nadmiar dwutlenku węgla i wydaje polecenie wydechu; drugi określa ilość tlenu i reguluje częstotliwość oddechów.
W mózgu znajduje się również tak zwany „ośrodek czkawki”. Czkawka to nagły skurcz przepony i strun głosowych spowodowany wdychaniem zbyt dużej ilości powietrza lub nadmiernym jedzeniem i piciem. Charakterystyczny dźwięk pojawia się, gdy nagłośnia się zamyka lub gdy struny głosowe otwierają się, gdy uderza w nie wydychane powietrze.
Śmiech jest również spowodowany serią nagłych wstrząsów przepony, które powodują uniesienie się powietrza do tchawicy i przejście przez rezonator. Zatem zarówno czkawka, jak i śmiech są kontrolowane przez mózg poprzez ośrodki oddechowe.