Disse fistler dannes nogle gange på grund af sår og perforering af anus, og nogle gange opstår de på grund af erosion af nyrekegler. Fistler i anus er ikke igennem, i så fald er de sikrere, men også gennem mere ondartede. Fistler placeret nær fordybningen og indgangen til tarmen er sikrere, fordi skaden, når den er perforeret, påvirker ikke hele musklen, men kun en del af den, mens resten af musklen udfører sin låsende effekt. Med hensyn til fistler fjernt fra anus, når de skæres, og dette er en behandlingsmetode, skæres hele obturatormusklen eller det meste af den, og evnen til at låse går helt tabt, hvilket fører til ufrivillig udskillelse af afføring. Nogle gange kommer fistler i kontakt med blodkar og nerver, hvilket er meget farligt.
Gennemgående og ikke-gennemgående fistler skelnes ved at indsætte en sonde i fistelen og en finger i anus. Med en finger mærker de det sted, hvor sonden er nået, og finder ud af, om fistelen er igennem eller ej; En gennemgående fistel er nogle gange også angivet ved udgangen af afføring gennem den. Om perforeringen påvirkede hele musklen eller en del af den, bestemmes på en måde, som en af de første gamle læger talte om, men den blev tilegnet af en af de efterfølgende. Nemlig: en finger føres ind i anus, en sonde føres ind i swish, patienten får besked på at klemme tarmen og trække den opad, og ved berøring bestemme hvilken del af musklen der er komprimeret og hvilken der stikker ud, hvad er bredden af den beskadigede del af musklen, der løber langs kroppen, hvad er afstanden i længden kroppen fra enden af sonden til overkanten - uanset om den er lille eller stor.
En gennemgående fistel opstår med et hul, og nogle gange med mange huller. Behandling. Med hensyn til ikke-gennemgående fistler, hvis de ikke forårsager lidelse på grund af kraftig blødning og overdreven stank, kan de efterlades som de er uden frygt; når de forårsager lidelse, forsøger de at behandle dem med stearinlys med pileolie og lignende midler mod fistler; hvis de helbreder dem eller mindsker skaden fra dem, godt, men hvis ikke, så bør der bruges skarp medicin for at ødelægge den ydre overflade af fistelen, altså det døde kød, og blotlægge det sunde sted. Smerterne lindres ved at påføre ghee på fistelen, samt rosenolie. Såret heles derefter med helende plaster, især "budbringerplastret". Dette plaster heler selv de fistler, der endnu ikke er blevet behandlet med noget skærende eller piercing, og desuden heler det lidt efter lidt og over lang tid. Den "sorte gips" heler også fistler. Gennem fistler behandles ved excision; ved excision bør man huske på det, vi sagde ovenfor. Fistler udskæres godt ved hjælp af snoet hår, som skal være tyndt, eller snoet silketråd, hvormed fistelen trækkes stramt og efterlades stram. Hvis dette giver stærke smerter, og der er frygt for, at der opstår spasmer eller andre slemme fænomener, så fjernes tråden, og der bruges smertelindrende midler, og så strammes fistelen igen.