Η χρώση Pappenheim είναι μια τεχνική χρώσης που χρησιμοποιείται στη μικροσκοπία για την αναγνώριση μικροοργανισμών στα δείγματα. Αναπτύχθηκε το 1928 από τον Γερμανό επιστήμονα Otto Pappenheim και πήρε το όνομά του.
Η χρώση Pappenheim συμβαίνει με την εφαρμογή μιας χρωστικής στο δείγμα που συνδέεται με το κυτταρικό τοίχωμα των μικροοργανισμών. Στη συνέχεια το δείγμα υποβάλλεται σε επεξεργασία με ένα οξύ, το οποίο καταστρέφει τα κύτταρα, αφήνοντας μόνο τις έγχρωμες πρωτεΐνες. Το δείγμα στη συνέχεια πλένεται και ξηραίνεται και διακρίνονται οι έγχρωμοι μικροοργανισμοί.
Αυτή η μέθοδος χρησιμοποιείται για την ανίχνευση διαφόρων μικροοργανισμών συμπεριλαμβανομένων βακτηρίων, μυκήτων και ιών. Είναι μια από τις πιο κοινές μεθόδους χρώσης που χρησιμοποιούνται στη μικροβιολογία και την ιατρική.