Kodon Nukleotida Opsional

Kodon nukleotida

Nukleotida kodon adalah basa yang menempati tempat tertentu dalam kodon dan merupakan bagian dari RNA transfer. Nukleotida kodon adalah adenin (A), guanin (G), sitosin (C), timin (T), dan urasil (U).

Menurut prinsip komplementaritas basa Watson-Crick, ketika dua untai DNA atau RNA dihubungkan satu sama lain, pasangan basa A - T, G - C dan Y - A terhubung.

kodon

Kodon adalah urutan nukleotida yang terletak pada RNA transfer yang sesuai dengan residu asam amino spesifik dalam molekul protein. Setiap kodon terdiri dari tiga nukleotida. Biasanya, kodon ditandai dengan singkatan tiga huruf.

Karakteristik penting kodon adalah kemampuannya mengkode asam amino dan frekuensi penggunaannya dalam molekul protein. Kodon yang mengkode asam amino yang sama disebut sinonim.

Kodon opsional dan wajib

Ada dua jenis kodon: wajib dan opsional. Kodon wajib selalu mengkode asam amino yang sama. Misalnya, pada protein insulin, kodon UAU akan selalu mengkode asam amino fenilalanin.

Namun, ada juga kodon opsional. Kodon opsional adalah kodon yang dapat mengkode satu atau lebih asam amino berbeda, bergantung pada kodon mana yang berada di sebelahnya dalam rantai.

Misalnya, kodon AUG mengkode asam amino metionin, tetapi juga dapat mengkode asam amino lain seperti valin dan isoleusin. Kodon CUG dapat mengkode tiga asam amino: glutamin, arginin, dan prolin.

Ada juga kodon yang hanya dapat mengkode satu asam amino.

Kodon nukleotida opsional adalah basa nukleotida yang biasanya ditemukan dalam kodon protein dan menjalankan fungsi ikatan hidrogen untuk perakitan asam amino yang benar ke dalam struktur primer protein. Namun, beberapa nukleotida dapat digantikan oleh nukleotida lain tanpa mempengaruhi kemampuan kodon untuk mengkode asam amino tertentu.

Diketahui bahwa setiap triplet mengkodekan asam amino tertentu dan urutan triplet ini menentukan urutan unik asam amino yang sesuai dengan protein tertentu. Namun, basa nukleotida yang terletak di tempat pertama atau terakhir kodon jarang berperan penting dalam pembentukan ikatan peptida dan dapat digantikan oleh basa nukleotida lain tanpa mengubah urutan asam amino protein. Nukleotida semacam itu sering kali dianggap tidak penting atau opsional dalam praktik analisis protein. Residu nukleotida opsional adalah nukleotida yang merupakan bagian dari kodon dan biasanya berfungsi sebagai dasar ikatan hidrogen dalam kodon tersebut. . Fakultatif berarti residu ini dapat digantikan oleh residu non-fakultatif (wajib) tanpa mengubah kemampuan protein yang disintesis untuk terdiri dari asam amino. Perbedaan ini terkadang disebut sebagai persyaratan sisa opsional.

Misalnya, dalam DNA, urutan nukleotida TaATacyl mengandung lima residu opsional: yang keempat (sitosin, ditandai dengan huruf A pada tabel pengkodean