Nukleotid kodonları
Kodonun nukleotidi kodonda xüsusi yer tutan və transfer RNT-nin bir hissəsi olan əsasdır. Kodon nukleotidləri adenin (A), guanin (G), sitozin (C), timin (T) və urasildir (U).
Watson-Crick əsas komplementarlığı prinsipinə görə, iki DNT və ya RNT zəncirinin bir-birinə bağlanması zamanı A - T, G - C və Y - A əsas cütləri birləşir.
Kodonlar
Kodonlar, zülal molekulunda müəyyən bir amin turşusu qalığına uyğun gələn transfer RNT-də yerləşən nukleotidlərin ardıcıllığıdır. Hər bir kodon üç nukleotiddən ibarətdir. Tipik olaraq, kodonlar üç hərfli abbreviatura ilə təyin olunur.
Kodonların mühüm xüsusiyyətləri onların bir amin turşusunu kodlaşdırma qabiliyyəti və zülal molekullarında istifadə tezliyidir. Eyni amin turşusunu kodlayan kodonlara sinonim deyilir.
Könüllü və məcburi kodonlar
Kodonların iki növü var: məcburi və isteğe bağlı. Tələb olunan kodonlar həmişə eyni amin turşusunu kodlayır. Məsələn, insulin zülalında UAU kodonu həmişə fenilalanin amin turşusunu kodlayacaq.
Bununla belə, isteğe bağlı kodonlar da var. İsteğe bağlı kodon, zəncirdə hansı kodonun yanında olduğundan asılı olaraq bir və ya daha çox müxtəlif amin turşularını kodlaya bilən kodondur.
Məsələn, AUG kodonu amin turşusu metionini kodlayır, eyni zamanda valin və izolösin kimi digər amin turşularını da kodlaya bilir. CUG kodonu üç amin turşusunu kodlaya bilir: glutamin, arginin və prolin.
Yalnız bir amin turşusunu kodlaya bilən kodonlar da var.
Könüllü nukleotid kodonları adətən zülal kodonlarında olan və amin turşularının zülalın ilkin strukturuna düzgün yığılması üçün hidrogen bağları funksiyasını yerinə yetirən nukleotid əsaslarıdır. Bununla belə, bəzi nukleotidlər kodonun müəyyən bir amin turşusu üçün kodlaşdırma qabiliyyətinə təsir etmədən başqaları ilə əvəz edilə bilər.
Məlumdur ki, hər üçlük müəyyən bir amin turşusunu kodlaşdırır və bu üçlülərin sırası müəyyən bir zülala uyğun gələn amin turşularının unikal ardıcıllığını müəyyən edir. Bununla belə, kodonun birinci və ya sonuncu yerində yerləşən nukleotid bazası nadir hallarda peptid bağının formalaşmasında əhəmiyyətli rol oynayır və zülalın amin turşusu ardıcıllığını dəyişdirmədən hər hansı digər nukleotid bazası ilə əvəz edilə bilər. Zülal analizi praktikasında belə nukleotidlər çox vaxt əhəmiyyətsiz və ya isteğe bağlı hesab olunur. İsteğe bağlı nukleotid qalığı kodonun bir hissəsi olan və adətən həmin kodonda hidrogen bağı üçün əsas kimi xidmət edən nukleotiddir. . Fakultativ dedikdə, sintez edilən zülalın aminturşulardan ibarət olma qabiliyyətini dəyişmədən bu qalığın qeyri-fakultativ (məcburi) qalıq ilə əvəz oluna bilməsi nəzərdə tutulur. Bu fərq bəzən isteğe bağlı qalıq tələbi kimi istinad edilir.
Məsələn, DNT-də TaATacyl nukleotid ardıcıllığı beş isteğe bağlı qalıq ehtiva edir: dördüncü (kodlaşdırma cədvəlində A hərfi ilə təyin olunan sitozin)