Códons de nucleotídeos
O nucleotídeo de um códon é a base que ocupa um lugar específico no códon e faz parte do RNA transportador. Os nucleotídeos do códon são adenina (A), guanina (G), citosina (C), timina (T) e uracila (U).
De acordo com o princípio de complementaridade de bases de Watson-Crick, quando duas fitas de DNA ou RNA são conectadas entre si, os pares de bases A - T, G - C e Y - A estão conectados.
Códons
Códons são sequências de nucleotídeos localizadas no RNA de transferência que correspondem a um resíduo de aminoácido específico em uma molécula de proteína. Cada códon consiste em três nucleotídeos. Normalmente, os códons são designados por abreviações de três letras.
Características importantes dos códons são sua capacidade de codificar um aminoácido e sua frequência de uso em moléculas de proteínas. Os códons que codificam o mesmo aminoácido são chamados de sinônimos.
Códons opcionais e obrigatórios
Existem dois tipos de códons: obrigatórios e opcionais. Os códons necessários sempre codificam o mesmo aminoácido. Por exemplo, na proteína da insulina, o códon UAU sempre codificará o aminoácido fenilalanina.
No entanto, também existem códons opcionais. Um códon opcional é um códon que pode codificar um ou mais aminoácidos diferentes, dependendo de qual códon está próximo a ele na cadeia.
Por exemplo, o códon AUG codifica o aminoácido metionina, mas também pode codificar outros aminoácidos, como valina e isoleucina. O códon CUG pode codificar três aminoácidos: glutamina, arginina e prolina.
Existem também códons que podem codificar apenas um aminoácido.
Códons de nucleotídeos opcionais são bases de nucleotídeos geralmente encontradas em códons de proteínas e desempenham a função de ligações de hidrogênio para a montagem correta de aminoácidos na estrutura primária da proteína. No entanto, alguns nucleotídeos podem ser substituídos por outros sem afetar a capacidade do códon de codificar um aminoácido específico.
Sabe-se que cada tripleto codifica um aminoácido específico e a ordem destes tripletos determina a sequência única de aminoácidos correspondente a uma proteína específica. No entanto, a base nucleotídica localizada no primeiro ou último lugar do códon raramente desempenha um papel significativo na formação da ligação peptídica e pode ser substituída por qualquer outra base nucleotídica sem alterar a sequência de aminoácidos da proteína. Tais nucleotídeos são frequentemente considerados insignificantes ou opcionais na prática da análise de proteínas. Um resíduo de nucleotídeo opcional é um nucleotídeo que faz parte de um códon e geralmente serve como base para uma ligação de hidrogênio nesse códon. . Facultativo significa que este resíduo pode ser substituído por um resíduo não facultativo (obrigatório) sem alterar a capacidade da proteína sintetizada de consistir em aminoácidos. Essa diferença às vezes é chamada de requisito de restante opcional.
Por exemplo, no DNA, a sequência de nucleotídeos TaATacyl contém cinco resíduos opcionais: o quarto (citosina, designado pela letra A na tabela de codificação