Nükleotid Kodon İsteğe Bağlı

Nükleotid kodonları

Bir kodonun nükleotidi, kodonda belirli bir yeri kaplayan ve transfer RNA'nın bir parçası olan bazdır. Kodon nükleotidleri adenin (A), guanin (G), sitozin (C), timin (T) ve urasildir (U).

Watson-Crick baz tamamlayıcılığı ilkesine göre, iki DNA veya RNA zinciri birbirine bağlandığında A - T, G - C ve Y - A baz çiftleri bağlanır.

Kodonlar

Kodonlar, bir protein molekülündeki belirli bir amino asit kalıntısına karşılık gelen, transfer RNA'sında bulunan nükleotid dizileridir. Her kodon üç nükleotidden oluşur. Tipik olarak kodonlar üç harfli kısaltmalarla gösterilir.

Kodonların önemli özellikleri, bir amino asidi kodlayabilmeleri ve protein moleküllerinde kullanılma sıklıklarıdır. Aynı amino asidi kodlayan kodonlara eşanlamlı denir.

İsteğe bağlı ve zorunlu kodonlar

İki tür kodon vardır: zorunlu ve isteğe bağlı. Gerekli kodonlar her zaman aynı amino asidi kodlar. Örneğin insülin proteininde UAU kodonu her zaman fenilalanin amino asidini kodlayacaktır.

Ancak isteğe bağlı kodonlar da vardır. İsteğe bağlı bir kodon, zincirde yanında hangi kodonun olduğuna bağlı olarak bir veya daha fazla farklı amino asidi kodlayabilen bir kodondur.

Örneğin, AUG kodonu metionin amino asidini kodlar, fakat aynı zamanda valin ve izolösin gibi diğer amino asitleri de kodlayabilir. CUG kodonu üç amino asidi kodlayabilir: glutamin, arginin ve prolin.

Ayrıca yalnızca bir amino asidi kodlayabilen kodonlar da vardır.

İsteğe bağlı nükleotid kodonları, genellikle protein kodonlarında bulunan ve amino asitlerin proteinin birincil yapısına doğru şekilde birleştirilmesi için hidrojen bağları işlevini yerine getiren nükleotid bazlardır. Ancak bazı nükleotidler, kodonun belirli bir amino asidi kodlama yeteneğini etkilemeden başkalarıyla değiştirilebilir.

Her üçlünün belirli bir amino asidi kodladığı ve bu üçlülerin sırasının, belirli bir proteine ​​karşılık gelen amino asitlerin benzersiz dizisini belirlediği bilinmektedir. Bununla birlikte, kodonun ilk veya son yerinde bulunan nükleotid bazı, peptid bağının oluşumunda nadiren önemli bir rol oynar ve proteinin amino asit dizisini değiştirmeden başka herhangi bir nükleotid bazı ile değiştirilebilir. Bu tür nükleotidler, protein analizi uygulamasında sıklıkla önemsiz veya isteğe bağlı olarak kabul edilir. İsteğe bağlı bir nükleotid kalıntısı, bir kodonun parçası olan ve genellikle o kodondaki bir hidrojen bağının temelini oluşturan bir nükleotiddir. . Fakültatif, sentezlenen proteinin amino asitlerden oluşma kabiliyetini değiştirmeden bu tortunun fakültatif olmayan (zorunlu) bir tortuyla değiştirilebileceği anlamına gelir. Bu farka bazen isteğe bağlı kalan şartı da denir.

Örneğin, DNA'da, TaATasil nükleotid dizisi beş isteğe bağlı kalıntı içerir: dördüncüsü (kodlama tablosunda A harfiyle gösterilen sitozin)