Kodon nukleotydowy opcjonalny

Kodony nukleotydów

Nukleotyd kodonu to zasada zajmująca określone miejsce w kodonie i będąca częścią transferowego RNA. Nukleotydy kodonów to adenina (A), guanina (G), cytozyna (C), tymina (T) i uracyl (U).

Zgodnie z zasadą komplementarności zasad Watsona-Cricka, gdy dwie nici DNA lub RNA są ze sobą połączone, połączone są pary zasad A - T, G - C i Y - A.

Kodony

Kodony to sekwencje nukleotydów zlokalizowane na transferowym RNA, które odpowiadają określonej reszcie aminokwasowej w cząsteczce białka. Każdy kodon składa się z trzech nukleotydów. Zazwyczaj kodony są oznaczone trzyliterowymi skrótami.

Ważnymi cechami kodonów jest ich zdolność do kodowania aminokwasu i częstotliwość ich stosowania w cząsteczkach białka. Kodony kodujące ten sam aminokwas nazywane są synonimami.

Kodony opcjonalne i obowiązkowe

Istnieją dwa typy kodonów: obowiązkowe i opcjonalne. Wymagane kodony zawsze kodują ten sam aminokwas. Na przykład w białku insuliny kodon UAU będzie zawsze kodować aminokwas fenyloalaninę.

Istnieją jednak także opcjonalne kodony. Opcjonalny kodon to kodon, który może kodować jeden lub więcej różnych aminokwasów, w zależności od tego, który kodon znajduje się obok niego w łańcuchu.

Na przykład kodon AUG koduje aminokwas metioninę, ale może również kodować inne aminokwasy, takie jak walina i izoleucyna. Kodon CUG może kodować trzy aminokwasy: glutaminę, argininę i prolinę.

Istnieją również kodony, które mogą kodować tylko jeden aminokwas.

Opcjonalne kodony nukleotydowe to zasady nukleotydowe, które zwykle znajdują się w kodonach białek i pełnią funkcję wiązań wodorowych w celu prawidłowego składania aminokwasów w pierwszorzędową strukturę białka. Jednakże niektóre nukleotydy można zastąpić innymi bez wpływu na zdolność kodonu do kodowania określonego aminokwasu.

Wiadomo, że każdy triplet koduje specyficzny aminokwas, a kolejność tych tripletów określa unikalną sekwencję aminokwasów odpowiadającą konkretnemu białku. Jednakże zasada nukleotydowa znajdująca się na pierwszym lub ostatnim miejscu kodonu rzadko odgrywa znaczącą rolę w tworzeniu wiązania peptydowego i można ją zastąpić dowolną inną zasadą nukleotydową bez zmiany sekwencji aminokwasów białka. Takie nukleotydy są często uważane za nieistotne lub opcjonalne w praktyce analizy białek. Opcjonalna reszta nukleotydowa to nukleotyd, który jest częścią kodonu i zwykle służy jako podstawa wiązania wodorowego w tym kodonie. . Fakultatywna oznacza, że ​​resztę tę można zastąpić resztą niefakultatywną (obowiązkową), bez zmiany zdolności syntetyzowanego białka do składania aminokwasów. Różnica ta jest czasami nazywana wymogiem dotyczącym opcjonalnej reszty.

Na przykład w DNA sekwencja nukleotydów TaATacyl zawiera pięć opcjonalnych reszt: czwartą (cytozynę, oznaczoną literą A w tabeli kodowania