Codon nucleotide
Nucleotide của codon là base chiếm một vị trí cụ thể trong codon và là một phần của RNA vận chuyển. Các nucleotide codon là adenine (A), guanine (G), cytosine (C), thymine (T) và uracil (U).
Theo nguyên lý bổ sung bazơ của Watson-Crick, khi hai chuỗi DNA hoặc RNA nối với nhau thì các cặp bazơ A - T, G - C và Y - A được kết nối với nhau.
codon
Codon là trình tự các nucleotide nằm trên RNA vận chuyển tương ứng với một dư lượng axit amin cụ thể trong phân tử protein. Mỗi codon bao gồm ba nucleotide. Thông thường, codon được chỉ định bằng chữ viết tắt ba chữ cái.
Đặc điểm quan trọng của codon là khả năng mã hóa axit amin và tần suất sử dụng của chúng trong các phân tử protein. Các codon mã hóa cho cùng một axit amin được gọi là đồng nghĩa.
Codon tùy chọn và bắt buộc
Có hai loại codon: bắt buộc và tùy chọn. Các codon cần thiết luôn mã hóa cho cùng một loại axit amin. Ví dụ, trong protein insulin, codon UAU sẽ luôn mã hóa axit amin phenylalanine.
Tuy nhiên, cũng có những codon tùy chọn. Codon tùy chọn là codon có thể mã hóa một hoặc nhiều axit amin khác nhau, tùy thuộc vào codon nào đứng cạnh nó trong chuỗi.
Ví dụ, codon AUG mã hóa cho axit amin methionine nhưng cũng có thể mã hóa cho các axit amin khác như valine và isoleucine. Codon CUG có thể mã hóa cho ba axit amin: glutamine, arginine và proline.
Ngoài ra còn có codon chỉ mã hoá cho một axit amin.
Các codon nucleotide tùy chọn là các bazơ nucleotide thường được tìm thấy trong các codon protein và thực hiện chức năng liên kết hydro để lắp ráp chính xác các axit amin vào cấu trúc bậc một của protein. Tuy nhiên, một số nucleotide có thể được thay thế bằng những nucleotide khác mà không ảnh hưởng đến khả năng mã hóa một axit amin cụ thể của codon.
Được biết, mỗi bộ ba mã hóa một axit amin cụ thể và thứ tự của các bộ ba này xác định trình tự axit amin duy nhất tương ứng với một loại protein cụ thể. Tuy nhiên, bazơ nucleotide nằm ở vị trí đầu tiên hoặc cuối cùng của codon hiếm khi đóng vai trò quan trọng trong việc hình thành liên kết peptide và có thể được thay thế bằng bất kỳ bazơ nucleotide nào khác mà không làm thay đổi trình tự axit amin của protein. Các nucleotide như vậy thường được coi là không đáng kể hoặc không bắt buộc trong thực hành phân tích protein. Gốc nucleotit tùy chọn là nucleotit là một phần của codon và thường đóng vai trò làm cơ sở cho liên kết hydro trong codon đó. . Tùy ý có nghĩa là dư lượng này có thể được thay thế bằng dư lượng không bắt buộc (bắt buộc) mà không làm thay đổi khả năng của protein tổng hợp bao gồm các axit amin. Sự khác biệt này đôi khi được gọi là yêu cầu còn lại tùy chọn.
Ví dụ, trong DNA, trình tự nucleotide TaATacyl chứa năm gốc tùy chọn: gốc thứ tư (cytosine, được ký hiệu bằng chữ A trong bảng mã hóa).