Nukleotidkodon valgfritt

Nukleotider kodoner

Nukleotidet til et kodon er basen som opptar et spesifikt sted i kodonet og er en del av overførings-RNA. Kodonnukleotidene er adenin (A), guanin (G), cytosin (C), tymin (T) og uracil (U).

I henhold til Watson-Crick-prinsippet om basekomplementaritet, når to tråder av DNA eller RNA er koblet til hverandre, er baseparene A - T, G - C og Y - A forbundet.

Kodoner

Kodoner er sekvenser av nukleotider lokalisert på overførings-RNA som tilsvarer en spesifikk aminosyrerest i et proteinmolekyl. Hvert kodon består av tre nukleotider. Typisk er kodoner betegnet med trebokstavsforkortelser.

Viktige egenskaper ved kodoner er deres evne til å kode for en aminosyre og deres bruksfrekvens i proteinmolekyler. Kodoner som koder for den samme aminosyren kalles synonyme.

Valgfrie og obligatoriske kodoner

Det finnes to typer kodoner: obligatoriske og valgfrie. Nødvendige kodoner koder alltid for den samme aminosyren. For eksempel, i insulinproteinet vil UAU-kodonet alltid kode for aminosyren fenylalanin.

Imidlertid er det også valgfrie kodoner. Et valgfritt kodon er et kodon som kan kode for en eller flere forskjellige aminosyrer, avhengig av hvilket kodon som er ved siden av i kjeden.

For eksempel koder AUG-kodonet for aminosyren metionin, men kan også kode for andre aminosyrer som valin og isoleucin. CUG-kodonet kan kode for tre aminosyrer: glutamin, arginin og prolin.

Det finnes også kodoner som kan kode for kun én aminosyre.

Valgfrie nukleotidkodoner er nukleotidbaser som vanligvis finnes i proteinkodoner og utfører funksjonen til hydrogenbindinger for riktig sammenstilling av aminosyrer til proteinets primærstruktur. Noen nukleotider kan imidlertid erstattes av andre uten å påvirke kodonets evne til å kode for en spesifikk aminosyre.

Det er kjent at hver triplett koder for en spesifikk aminosyre og rekkefølgen på disse tripletter bestemmer den unike sekvensen av aminosyrer som tilsvarer et spesifikt protein. Imidlertid spiller nukleotidbasen lokalisert på det første eller siste stedet av kodonet sjelden en signifikant rolle i dannelsen av peptidbindingen og kan erstattes av en hvilken som helst annen nukleotidbase uten å endre aminosyresekvensen til proteinet. Slike nukleotider betraktes ofte som ubetydelige eller valgfrie ved utøvelse av proteinanalyse. En valgfri nukleotidrest er et nukleotid som er en del av et kodon og vanligvis tjener som grunnlag for en hydrogenbinding i det kodonet. . Fakultativ betyr at denne resten kan erstattes av en ikke-fakultativ (obligatorisk) rest uten å endre evnen til det syntetiserte proteinet til å bestå av aminosyrer. Denne forskjellen blir noen ganger referert til som det valgfrie restkravet.

For eksempel, i DNA, inneholder nukleotidsekvensen TaATacyl fem valgfrie rester: den fjerde (cytosin, angitt med bokstaven A i kodetabellen