Nukleotid kodon Nem kötelező

Nukleotidok kodonok

A kodon nukleotidja az a bázis, amely meghatározott helyet foglal el a kodonban, és része a transzfer RNS-nek. A kodon nukleotidok az adenin (A), guanin (G), citozin (C), timin (T) és uracil (U).

A báziskomplementaritás Watson-Crick elve szerint, ha két DNS vagy RNS szál kapcsolódik egymáshoz, az A - T, G - C és Y - A bázispárok kapcsolódnak egymáshoz.

Kodonok

A kodonok olyan nukleotidszekvenciák, amelyek a transzfer RNS-en helyezkednek el, és amelyek egy fehérjemolekula specifikus aminosav-oldalláncának felelnek meg. Minden kodon három nukleotidból áll. A kodonokat jellemzően hárombetűs rövidítésekkel jelölik.

A kodonok fontos jellemzői az aminosav kódolására való képességük és a fehérjemolekulákban való felhasználásuk gyakorisága. Az ugyanazt az aminosavat kódoló kodonokat szinonimáknak nevezzük.

Opcionális és kötelező kodonok

Kétféle kodon létezik: kötelező és opcionális. A szükséges kodonok mindig ugyanazt az aminosavat kódolják. Például az inzulinfehérjében az UAU kodon mindig a fenilalanin aminosavat fogja kódolni.

Vannak azonban opcionális kodonok is. Az opcionális kodon olyan kodon, amely egy vagy több különböző aminosavat kódolhat, attól függően, hogy a láncban melyik kodon található mellette.

Például az AUG kodon a metionin aminosavat kódolja, de kódolhat más aminosavakat is, mint például a valin és az izoleucin. A CUG kodon három aminosavat kódolhat: glutamint, arginint és prolint.

Vannak olyan kodonok is, amelyek csak egy aminosavat képesek kódolni.

Az opcionális nukleotid kodonok olyan nukleotid bázisok, amelyek általában a fehérje kodonokban találhatók, és hidrogénkötések funkcióját töltik be az aminosavak megfelelő összeállítása érdekében a fehérje elsődleges szerkezetébe. Egyes nukleotidok azonban helyettesíthetők másokkal anélkül, hogy ez befolyásolná a kodon azon képességét, hogy egy adott aminosavat kódoljon.

Ismeretes, hogy minden hármas egy specifikus aminosavat kódol, és ezeknek a tripleteknek a sorrendje határozza meg az aminosavak egyedi szekvenciáját, amelyek egy adott fehérjéhez tartoznak. A kodon első vagy utolsó helyén található nukleotidbázis azonban ritkán játszik jelentős szerepet a peptidkötés kialakításában, és bármely más nukleotidbázissal helyettesíthető anélkül, hogy a fehérje aminosav-szekvenciáját megváltoztatná. Az ilyen nukleotidokat gyakran jelentéktelennek vagy opcionálisnak tekintik a fehérjeanalízis gyakorlatában. Az opcionális nukleotidmaradék olyan nukleotid, amely egy kodon része, és általában a kodonban lévő hidrogénkötés alapjául szolgál. . A fakultatív azt jelenti, hogy ez a maradék helyettesíthető egy nem fakultatív (kötelező) aminosavval anélkül, hogy a szintetizált fehérje aminosavakból álló képessége megváltozna. Ezt a különbséget néha opcionális maradékkövetelménynek is nevezik.

Például a DNS-ben a TaATacyl nukleotidszekvencia öt opcionális maradékot tartalmaz: a negyediket (citozin, A betűvel jelölve a kódoló táblázatban