Nucleotidecodon Optioneel

Nucleotiden codons

Het nucleotide van een codon is de base die een specifieke plaats in het codon inneemt en deel uitmaakt van het transfer-RNA. De codonnucleotiden zijn adenine (A), guanine (G), cytosine (C), thymine (T) en uracil (U).

Volgens het Watson-Crick-principe van basencomplementariteit zijn, wanneer twee strengen DNA of RNA met elkaar zijn verbonden, de basenparen A - T, G - C en Y - A met elkaar verbonden.

Codonen

Codons zijn sequenties van nucleotiden die zich op transfer-RNA bevinden en die overeenkomen met een specifiek aminozuurresidu in een eiwitmolecuul. Elk codon bestaat uit drie nucleotiden. Typisch worden codons aangeduid met afkortingen van drie letters.

Belangrijke kenmerken van codons zijn hun vermogen om voor een aminozuur te coderen en hun gebruiksfrequentie in eiwitmoleculen. Codons die voor hetzelfde aminozuur coderen, worden synoniem genoemd.

Optionele en verplichte codons

Er zijn twee soorten codons: verplicht en optioneel. Vereiste codons coderen altijd voor hetzelfde aminozuur. In het insuline-eiwit codeert het UAU-codon bijvoorbeeld altijd voor het aminozuur fenylalanine.

Er zijn echter ook optionele codons. Een optioneel codon is een codon dat kan coderen voor een of meer verschillende aminozuren, afhankelijk van welk codon ernaast in de keten zit.

Het AUG-codon codeert bijvoorbeeld voor het aminozuur methionine, maar kan ook coderen voor andere aminozuren zoals valine en isoleucine. Het CUG-codon kan coderen voor drie aminozuren: glutamine, arginine en proline.

Er zijn ook codons die voor slechts één aminozuur kunnen coderen.

Optionele nucleotidecodons zijn nucleotidebasen die gewoonlijk in eiwitcodons worden aangetroffen en de functie van waterstofbruggen vervullen voor de juiste assemblage van aminozuren in de primaire structuur van het eiwit. Sommige nucleotiden kunnen echter door andere worden vervangen zonder het vermogen van het codon om voor een specifiek aminozuur te coderen te beïnvloeden.

Het is bekend dat elk triplet codeert voor een specifiek aminozuur en de volgorde van deze tripletten bepaalt de unieke sequentie van aminozuren die overeenkomen met een specifiek eiwit. De nucleotidebase die zich op de eerste of laatste plaats van het codon bevindt, speelt echter zelden een significante rol bij de vorming van de peptidebinding en kan worden vervangen door elke andere nucleotidebase zonder de aminozuursequentie van het eiwit te veranderen. Dergelijke nucleotiden worden in de praktijk van eiwitanalyse vaak als onbeduidend of optioneel beschouwd. Een optioneel nucleotideresidu is een nucleotide dat deel uitmaakt van een codon en gewoonlijk dient als basis voor een waterstofbinding in dat codon. . Facultatief betekent dat dit residu kan worden vervangen door een niet-facultatief (verplicht) residu zonder het vermogen van het gesynthetiseerde eiwit om uit aminozuren te bestaan ​​te veranderen. Dit verschil wordt ook wel de optionele restvereiste genoemd.

In DNA bevat de nucleotidesequentie TaATacyl bijvoorbeeld vijf optionele residuen: de vierde (cytosine, aangeduid met de letter A in de coderingstabel