I protozoi, come l'ameba, non hanno un sistema digestivo perché il loro corpo è costituito da un'unica cellula. I nutrienti vengono assorbiti attraverso l'intera superficie della cellula. L'ameba cattura le particelle di cibo, formando vacuoli alimentari attorno ad esse. È in questi vacuoli che il cibo viene digerito con l'aiuto di enzimi.
Anche l'idra non ha organi digestivi differenziati. Il suo corpo è costituito da due strati di cellule: ectoderma ed endoderma. La digestione viene effettuata dalle cellule dell'endoderma. Il cibo entra attraverso la bocca nella cavità interna, dove viene digerito.
I Planaria hanno un sistema digestivo primitivo costituito da bocca, faringe e stomaco ramificato. Tuttavia, non c'è l'ano. La digestione avviene sia all'interno delle cellule che nella cavità dello stomaco.
Il lombrico possiede già un apparato digerente completo con bocca e ano. Comprende la faringe, l'esofago, lo stomaco e l'intestino. La digestione è prevalentemente extracellulare.
Nei vertebrati il sistema digestivo è diventato molto più complesso, con l’aggiunta di nuovi organi come il fegato e il pancreas. Ma il principio della sua struttura è rimasto lo stesso, dai pesci agli esseri umani. Anche la chimica e gli enzimi digestivi sono molto simili tra gli animali a diversi livelli di organizzazione.
Pertanto, nel processo di evoluzione, il sistema digestivo è diventato gradualmente più complesso dagli animali più semplici a quelli superiori, acquisendo una crescente differenziazione degli organi e l'efficienza dei processi di digestione e assimilazione del cibo.