Alkueläimillä, kuten ameballa, ei ole ruoansulatusjärjestelmää, koska niiden ruumis koostuu yhdestä solusta. Ravinteet imeytyvät solun koko pinnalta. Ameba vangitsee ruokahiukkasia muodostaen ruokavakuoleja niiden ympärille. Näissä tyhjiöissä ruoka pilkotaan entsyymien avulla.
Hydralla ei myöskään ole erilaistuneita ruoansulatuselimiä. Sen runko koostuu kahdesta solukerroksesta - ektodermista ja endodermista. Ruoansulatuksen suorittavat endodermisolut. Ruoka menee suun kautta sisäonteloon, jossa se sulautuu.
Planarialla on primitiivinen ruoansulatusjärjestelmä, joka koostuu suusta, nielusta ja haarautuneesta mahasta. Peräaukkoa ei kuitenkaan ole. Ruoansulatus tapahtuu sekä solujen sisällä että mahalaukussa.
Kastematolla on jo täydellinen ruoansulatusjärjestelmä, jossa on suu ja peräaukko. Se sisältää nielun, ruokatorven, mahan ja suolet. Ruoansulatus on pääasiassa solunulkoista.
Selkärankaisilla ruoansulatusjärjestelmästä tuli huomattavasti monimutkaisempi, kun siihen lisättiin uusia elimiä, kuten maksa ja haima. Mutta sen rakenteen periaate pysyi samana kaloista ihmisiin. Ruoansulatuskemia ja entsyymit ovat myös hyvin samankaltaisia eri organisaatiotasoilla olevien eläinten välillä.
Siten evoluutioprosessissa ruoansulatusjärjestelmä muuttui vähitellen monimutkaisemmaksi yksinkertaisimmista korkeampiin eläimiin, mikä sai elinten lisääntyvän erilaistumisen ja ruoansulatus- ja assimilaatioprosessien tehokkuuden.