Evnen til patogene mikrober, til tross for deres ubetydelige størrelse, til å forårsake alvorlig sykdom og til og med død av en så stor organisme som en person, skyldes tre faktorer.
Den første av dem er den utrolige reproduksjonshastigheten, som lar mikrober øke antallet til mange milliarder individer på noen få timer, noe som skaper en enorm fysiologisk belastning på vev.
Den andre faktoren er deres evne til å ødelegge kroppsvev og dermed forstyrre funksjonen til visse organer.
Men kanskje den mest formidable faktoren er den tredje angrepsmetoden - produksjonen av giftige stoffer kalt giftstoffer. Giftstoffer påvirker vanligvis ikke kroppen som helhet, men ett spesifikt organ eller ett organsystem, og forårsaker et karakteristisk sett med symptomer som en lege kan diagnostisere sykdommen og identifisere dens årsak til.
Giftige stoffer produsert av bakterier kan deles inn i to typer: eksotoksiner og endotoksiner. Et eksotoksin er en ekstremt kraftig gift som frigjøres av en bakteriecelle til miljøet. Eksotoksiner er svært giftige, men blir lett ødelagt.
Endotoksiner dannes inne i bakteriecellen og frigjøres etter dens død. De er mindre giftige enn eksotoksiner, men er motstandsdyktige mot varme og enzymer.
Hver art av patogene bakterier kombinerer evnen til å invadere vev og produsere giftstoffer. De farligste artene er de som kombinerer høy toksisitet med uttalt invasivitet.