Benthos (fra det græske "benthos" - havbund) er et økosystem af bundfauna af have og ferskvandsområder. Denne del af havet er hjemsted for mange arter af levende organismer, herunder bakterier, alger, bløddyr, krebsdyr, fisk og andre havdyr. Benthos er en vigtig bestanddel af det marine økosystem og spiller en vigtig rolle i det globale kulstofkredsløb.
Bundfaunaen i have og ferskvand har en unik tilpasning til livet under forhold med konstant tryk, lav temperatur og ernæring. Mange arter i benthos har lysende organer for at tiltrække bytte eller for at kommunikere med andre af deres arter. Bentos er også hjemsted for mange truede arter såsom forskellige arter af krabber, hvaler og mange andre.
En af benthos hovedfunktioner er at fungere som et filter for havvand. Det absorberer og tilbageholder store mængder organiske og uorganiske stoffer, hvilket er med til at forbedre vandkvaliteten og bevare biodiversiteten. Benthos spiller også en vigtig rolle i det globale kulstofkredsløb, da de fleste arter, der lever i benthos, er forkalkninger, dvs. danner deres skeletter og skaller af calcium.
Imidlertid er benthos også blevet ofre for menneskeskabt påvirkning. Havvandsforurening, klimaændringer og havbundsødelæggelse på grund af fiskeri og dybhavsolie- og gasefterforskning forårsager fald i bestandene af mange bentiske arter. Dette kan igen føre til alvorlige konsekvenser for hele det marine økosystem.
Generelt er benthos et vigtigt element i det marine økosystem, som spiller en vigtig rolle i at bevare biodiversiteten og bevare havvandskvaliteten. Men for at bevare dette økosystem skal der træffes foranstaltninger til at beskytte og bevare havmiljøet.