Avtonom sinir sistemi bədənin daxili fəaliyyətini tənzimləyir - qan dövranı, tənəffüs, həzm. O, qeyri-iradidir, çünki onun fəaliyyəti bizim iradəmizdən asılı deyil və periferik və ya könüllü sinir sistemi ilə koordinasiyada fəaliyyət göstərir. Avtonom sinir sistemi onurğanın hər iki tərəfində yerləşən qanqliyalardan və ya böyük neyron kolleksiyalarından başlayır və iki bölmə vasitəsilə fəaliyyət göstərir: simpatik və parasimpatik.
Avtonom sinir sisteminin simpatik şöbəsi fövqəladə hallarda və ya yüksək enerji istehlakı hallarında bədən orqanlarının fəaliyyətini aktivləşdirmək və müxtəlif reaksiyaları stimullaşdırmaq vəzifəsini yerinə yetirir: maddələr mübadiləsini artırır, beyinə qan tədarükünü artırır, bronxları və şagirdləri genişləndirir, tərləmə və ürək döyüntülərini artırır, sıxılma arteriyaları vasitəsilə qan təzyiqini artırır, böyrəküstü vəziləri stimullaşdırır.
Avtonom sinir sisteminin parasimpatik bölməsi əks, tormozlayıcı funksiyanı yerinə yetirir: bədən enerjiyə qənaət etdiyi üçün bu sinir sistemindən istirahət və istirahət vəziyyətində istifadə edir. Həzmdə iştirak edir, buna görə yeməkdən sonra yuxulu olursunuz. Parasimpatik sinir sistemi ürəyin döyüntüsünü ləngidir, tənəffüs yollarını daraldır, qan təzyiqini aşağı salır, burun, tüpürcək və gözyaşı vəzilərinin ifrazını artırır, peristaltik hərəkətləri və bağırsaq ifrazını artırır.