En allergisk reaksjon er en immunopatologisk prosess rettet mot kroppens eget "selv" i stedet for et objekt som er nøytralt for det. Det vil si at immunsystemet begynner å angripe ufarlige molekyler, og over tid blir kroppen så følsom for dem at når de kommer inn i kroppen, utløses en betennelsesreaksjon.
Mange mennesker har allergier. De fleste voksne har ikke allergier, dette er fordi symptomene dukker opp hos dem i barndommen og deretter forsvinner. Men for noen mennesker forverres allergisymptomer, noe som forårsaker irritasjon eller en hyperaktiv reaksjon når de møter et allergen.
Symptomer på mage-tarmkanalen og allergiske sykdommer kan være like, men mekanismen for utvikling og manifestasjon av reaksjoner er betydelig forskjellig. Kilden til den allergiske reaksjonen er mikrober og enzymer. Fordøyelsesavstøtende proteiner - for eksempel proteaser, som en faktor i den pro-inflammatoriske responsen på oralt allergen polypeptid eller histamin. Det er det kjemotaktiske stoffet som forårsaker rask ødeleggelse av immunsystemet på cellenivå.