Hver organisme måtte løse problemet med å fjerne unødvendige metabolske produkter. I protozoer, som amøber og tøfler, diffunderer disse produktene ganske enkelt gjennom cellemembranen inn i miljøet, hvor konsentrasjonen deres er lavere. Ferskvannsprotozoer har et spesielt problem - å bli kvitt overflødig vann, siden deres protoplasma, som er hypertonisk i forhold til damvann, har en tendens til å kontinuerlig absorbere det.
Dette ville uunngåelig føre til hevelse og brudd på cellen hvis slike protozoer ikke hadde en kontraktil vakuole - en liten boble som ligger i protoplasmaet, som "pumper" vann ut av cellen like raskt som vann kommer inn i den. I Hydra og andre coelenterater skjer direkte frigjøring av metabolske produkter gjennom cellemembranen. Hos større dyr er ikke frigjøring av stoffskifteprodukter ved diffusjon nok til å hindre opphopning av giftige stoffer; det er behov for ulike spesielle utskillelsesanordninger.
Flatorm har spesialiserte flammeceller - enkeltceller som absorberer væske fra mellomrommene rundt dem og skiller det ut i utskillelsesrørene. Tubulene som kommer fra flere "flammeceller" smelter sammen med hverandre og åpner seg til slutt ut gjennom utskillelsesporen. Slåingen av flimmerhårene til "flammecellene" ligner vibrasjonen til en stearinlysflamme, derav navnet deres.
Meitemark har et par spesialiserte organer i hvert kroppssegment, de såkalte nefridiene, som har en utskillende funksjon. Nephridium, i motsetning til "flammecellene" til flatorm, er en tubuli åpen i begge ender; dens indre ende åpner seg som en helhet i en trakt utstyrt med flimmerhår. Hver tubuli er omgitt av kapillærer, som tillater fjerning av avfallsstoffer fra blodet.
Når væsken, drevet av slag fra flimmerhårene i trakten, passerer gjennom nefridium, absorberes vann og stoffer som glukose tilbake, og avfallsstoffene konsentreres og skilles ut fra kroppen. Utskillelsessystemet til insekter består av organer kalt Malpighian tubuli, som ligger i kroppshulen og åpner seg i fordøyelseskanalen. Metabolske produkter diffunderer fra kroppshulen inn i disse rørene og slippes ut i fordøyelseskanalen, hvorfra de kommer ut sammen med ufordøyd mat.
Hos alle virveldyr er urinsystemet i utgangspunktet det samme. Hos lavere virveldyr åpner nyretubuli seg ikke inn i Bowmans kapsler, men inn i kroppshulen, og dermed er utskillelsesorganene deres mellomliggende mellom meitemarkens nefridier og nyrene til høyere virveldyr.
Virveldyr som lever i eller nær havet har utviklet spesielle tilpasninger for å fjerne salt. Benfisk, for eksempel, drikker saltvann og skiller deretter ut salt gjennom gjellene. Havskilpadder og måker kan skille ut salt fra å drikke sjøvann ved å bruke spesialiserte saltkjertler plassert i hodet. Kanalene til disse kjertlene åpner seg i nesehulene eller går ut til overflaten av hodet.
Utviklingen av urinsystemet kompliseres av det faktum at noen deler av dette systemet hos mange dyr er nært knyttet til reproduksjonssystemet, slik at en rekke organer er involvert i begge funksjonene. Denne sammenhengen er så nær at begge systemene ofte betraktes sammen under navnet kjønnsorganet.