Диарията с недостиг на витамини е доста рядко заболяване, причинено или от липса на хранителни вещества (витамини), или от пълното им отсъствие в организма. В резултат на такова недостатъчно хранене или неуспех на тялото да получи витамина, дори и да не са забелязани очевидни симптоми на недостиг на витамин, може да започне недостиг на витамин в стомаха и червата. Обикновено такъв симптом показва липса на няколко витамина едновременно, което може да бъде или клинична проява на заболяване, или независимо метаболитно нарушение и дефицит на витамини. Най-честите дефицити на витамини в стомашно-чревния тракт включват ксерофталмия, рахит и болест на Грей.
Диарията при недостиг на витамини е много опасна проява на недостиг на витамини. Липсата на необходимите витамини в организма може да доведе до изчерпване на нервната система - слабост, апатия, загуба на мускулна маса, загуба на паметта, психологически разстройства, смущения в работата на мозъка и зрителните органи. Дефицитът на някои витамини може да настъпи доста дълго време без клинични прояви, докато не се появи първото очевидно отрицателно последствие под формата на диария.