La deproteinizzazione (anche "proteolisi" o "deproteinizzazione") dei virus può essere descritta come il processo mediante il quale le proteine del virus che costituiscono il suo guscio esterno (o semplicemente il guscio) vengono scisse per rimuovere il materiale proteico dal guscio esterno del virus e impedirne l'ulteriore replicazione
La deproteinizzazione è una delle fasi della ricerca sui virus, simile all'interpretazione genetica nell'analisi dei virus. I virus sono tipicamente costituiti da proteine, ma nel caso delle infezioni umane la struttura è piuttosto complessa, rendendoli difficili da diagnosticare.
In questo processo, le proteine che ricoprono la superficie del virus vengono scomposte per accedere al loro DNA o RNA e identificare i geni coinvolti nella replicazione del virus. Come risultato di questa ricerca, i virus possono essere identificati in modo più accurato e identificati come causa di malattie specifiche.
Questo processo prevede fasi successive di separazione delle proteine dalle particelle virali, che possono verificarsi durante il trasporto e la coltivazione dei virus nel mezzo. Oggi esistono diversi metodi per degradare le proteine, sebbene la maggior parte si basi su enzimi e altre reazioni chimiche.