Die Deproteinisierung (auch „Proteolyse“ oder „Deproteinisierung“) von Viren kann als der Prozess beschrieben werden, bei dem die Proteine eines Virus, die seine äußere Hülle (oder einfach Schale) bilden, gespalten werden, um Proteinmaterial aus der äußeren Hülle des Virus zu entfernen und seine weitere Replikation verhindern
Die Deproteinisierung ist eine der Phasen der Virusforschung, ähnlich der genetischen Interpretation bei der Analyse von Viren. Viren bestehen typischerweise aus Proteinen, aber im Falle menschlicher Infektionen ist die Struktur recht kompliziert, was ihre Diagnose erschwert.
Bei diesem Prozess werden Proteine, die die Oberfläche des Virus bedecken, abgebaut, um auf deren DNA oder RNA zuzugreifen und Gene zu identifizieren, die an der Virusreplikation beteiligt sind. Als Ergebnis dieser Forschung können Viren genauer identifiziert und als Verursacher bestimmter Krankheiten identifiziert werden.
Dieser Prozess umfasst aufeinanderfolgende Stufen der Trennung von Proteinen von Viruspartikeln, die während des Transports und der Kultivierung von Viren im Medium auftreten können. Heutzutage gibt es mehrere Methoden zum Abbau von Proteinen, die meisten basieren jedoch auf Enzymen und anderen chemischen Reaktionen.