Η αποπρωτεϊνοποίηση (επίσης "πρωτεόλυση" ή "αποπρωτεϊνοποίηση") των ιών μπορεί να περιγραφεί ως η διαδικασία με την οποία οι πρωτεΐνες ενός ιού που αποτελούν το εξωτερικό του κέλυφος (ή απλά το κέλυφος) διασπώνται για να αφαιρεθεί το πρωτεϊνικό υλικό από το εξωτερικό κέλυφος του ιού. και αποτρέψτε την περαιτέρω αναπαραγωγή του
Η αποπρωτεϊνοποίηση είναι ένα από τα στάδια της έρευνας για τους ιούς, παρόμοια με τη γενετική ερμηνεία στην ανάλυση των ιών. Οι ιοί συνήθως αποτελούνται από πρωτεΐνες, αλλά στην περίπτωση των ανθρώπινων λοιμώξεων η δομή είναι αρκετά περίπλοκη, καθιστώντας δύσκολη τη διάγνωσή τους.
Σε αυτή τη διαδικασία, οι πρωτεΐνες που καλύπτουν την επιφάνεια του ιού διασπώνται για να αποκτήσουν πρόσβαση στο DNA ή το RNA τους και να αναγνωρίσουν τα γονίδια που εμπλέκονται στην αντιγραφή του ιού. Ως αποτέλεσμα αυτής της έρευνας, οι ιοί μπορούν να εντοπιστούν με μεγαλύτερη ακρίβεια και να αναγνωριστούν ως προκαλούν συγκεκριμένες ασθένειες.
Αυτή η διαδικασία περιλαμβάνει διαδοχικά στάδια διαχωρισμού πρωτεϊνών από ιικά σωματίδια, τα οποία μπορεί να συμβούν κατά τη μεταφορά και την καλλιέργεια ιών στο μέσο. Υπάρχουν πολλές μέθοδοι για την αποικοδόμηση των πρωτεϊνών σήμερα, αν και οι περισσότερες βασίζονται σε ένζυμα και άλλες χημικές αντιδράσεις.