Notokorden (fra de græske ord "noton" - ryg og "akkord" - streng) er en stavformet formation, der løber langs kroppens længdeakse og tjener som et midlertidigt skelet i alle chordaters embryoner. Hos nogle arter vedvarer den i voksenalderen, mens den i de fleste højere akkordater er erstattet af en rygsøjle.
Notokorden er en af nøglekarakteristika ved akkordater og betragtes som en af hovedårsagerne til, at disse dyr er grupperet sammen. Den blev først beskrevet i 1827 af den tyske zoolog Karl von Baer, der bemærkede ligheden mellem notokord og musikalske strenge.
I embryoner vises notokorden tidligere end andre skeletstrukturer og tjener som grundlag for udviklingen af rygsøjlen. Den voksne rygsøjle er en erstatning for notokorden og består af en række hvirvler forenet af led og adskilt af skiveformede mellemhvirvelskiver.
Notokorden er vigtig i udviklingen af embryonale væv og organer som nervesystemet og mesodermalt væv, som differentierer til muskler, knogler og bindevæv. Det tjener også som et omdrejningspunkt for musklerne og hjælper med at opretholde formen på embryonets krop.
I nogle arter af chordater, såsom amphioxus og lancelet, fortsætter notokorden i voksenalderen og spiller en vigtig rolle i at opretholde kropsform og bevægelse. Hos andre arter er notokorden erstattet af en rygsøjle, som udfører de samme funktioner.
Således er notokorden en vigtig struktur til at forstå udviklingen og udviklingen af akkordater. Dets tilstedeværelse i alle chordaters embryoner er et af de nøgleegenskaber, der forener dem i én gruppe, og det spiller en vigtig rolle i udviklingen af embryonale væv og organer.