Mikroorganisme yang disebut "anaerobik" adalah kelompok mikroorganisme khusus yang tidak dapat melakukan sebagian besar proses biokimia tanpa oksigen. Mereka hidup di tanah yang tidak memiliki cukup oksigen untuk memberi makan organisme aerobik. Organisme ini juga dikenal sebagai bakteri anaerob atau metanogen.
Bakteri anaerob menggunakan oksigen ketika tersedia, namun ketika oksigen tidak tersedia, mereka beralih ke sumber energi lain. Salah satu sumber tersebut adalah glukosa, yang diubah menjadi etanol dan kemudian menjadi karbon dioksida dan air. Bakteri anaerob juga menggunakan zat organik lain seperti karbohidrat dan lipid.
Metana seringkali dapat diproduksi oleh bakteri anaerobik dalam kondisi anoksik. Metana ini memiliki bau yang sangat tidak sedap dan ditemukan di banyak lapisan bumi, mulai dari lapisan permukaan hingga lapisan yang lebih dalam. Kehadiran metana dalam jumlah besar mengurangi kandungan oksigen di atmosfer