Az "anaerob" mikroorganizmusok a mikroorganizmusok egy speciális csoportja, amelyek oxigén nélkül nem képesek a legtöbb biokémiai folyamatot végrehajtani. Olyan talajban élnek, ahol nincs elég oxigén az aerob organizmusok táplálásához. Ezeket a szervezeteket anaerob baktériumoknak vagy metanogéneknek is nevezik.
Az anaerob baktériumok oxigént használnak fel, ha az elérhető, de ha nincs oxigén, más energiaforrásokhoz fordulnak. Az egyik ilyen forrás a glükóz, amely etanollá, majd szén-dioxiddá és vízzé alakul. Az anaerob baktériumok más szerves anyagokat is használnak, például szénhidrátokat és lipideket.
A metánt gyakran anaerob baktériumok termelhetik anoxikus körülmények között. Ez a metán kifejezetten kellemetlen szagú, és a Föld számos rétegében megtalálható, a felszíni rétegektől a mélyebb rétegekig. A metán nagy mennyiségben jelenléte csökkenti a légkör oxigéntartalmát