"Anaerobik" olarak adlandırılan mikroorganizmalar, çoğu biyokimyasal işlemi oksijen olmadan gerçekleştiremeyen özel bir mikroorganizma grubudur. Aerobik organizmaları beslemek için yeterli oksijenin bulunmadığı toprakta yaşarlar. Bu organizmalar aynı zamanda anaerobik bakteriler veya metanojenler olarak da bilinir.
Anaerobik bakteriler oksijen mevcut olduğunda kullanır, ancak oksijen bulunmadığında diğer enerji kaynaklarına yönelirler. Böyle bir kaynak, etanole ve daha sonra karbondioksit ve suya dönüştürülen glikozdur. Anaerobik bakteriler ayrıca karbonhidratlar ve lipitler gibi diğer organik maddeleri de kullanır.
Metan genellikle anoksik koşullarda anaerobik bakteriler tarafından üretilebilir. Bu metanın oldukça hoş olmayan bir kokusu var ve yüzey katmanlarından daha derin katmanlara kadar Dünya'nın birçok katmanında bulunuyor. Büyük miktarlarda metanın varlığı atmosferdeki oksijen içeriğini azaltır