I microrganismi chiamati "anaerobici" sono un gruppo speciale di microrganismi che non possono eseguire la maggior parte dei processi biochimici senza ossigeno. Vivono in terreni dove non c'è abbastanza ossigeno per nutrire gli organismi aerobici. Questi organismi sono anche conosciuti come batteri anaerobici o metanogeni.
I batteri anaerobici utilizzano l’ossigeno quando è disponibile, ma quando l’ossigeno non è disponibile si rivolgono ad altre fonti di energia. Una di queste fonti è il glucosio, che viene convertito in etanolo e poi in anidride carbonica e acqua. I batteri anaerobici utilizzano anche altre sostanze organiche come carboidrati e lipidi.
Il metano può spesso essere prodotto da batteri anaerobici in condizioni anossiche. Questo metano ha un odore decisamente sgradevole e si trova in molti strati della Terra, dagli strati superficiali a quelli più profondi. La presenza di metano in grandi quantità riduce il contenuto di ossigeno nell'atmosfera