Et antigen er et fremmed stoff, vanligvis et protein eller et polysakkarid-proteinkompleks, som, når det introduseres i kroppen, forårsaker dannelsen av spesifikke antistoffer. Antigener kan være av eksogen opprinnelse (f.eks. bakterielle toksiner) eller endogene (f.eks. vevsantigener). Interaksjonen mellom antigen og antistoff er grunnlaget for immunresponsen. Gjenkjennelse av et antigen av immunsystemet setter i gang en kaskade av reaksjoner som tar sikte på å nøytralisere det og fjerne det fra kroppen. Å forstå naturen og egenskapene til antigener er ekstremt viktig for å studere mekanismene for immunitet og utvikle vaksiner.