Malign infraspinöz nefrit, böbrek dokusunun lobüllerini histolojik inceleme sırasında görülebilen bireysel mikronekroz şeklinde etkiler. Sürecin başlangıcında, eksüdasyon baskındır, bu daha sonra proliferasyona yol açar, nekrotik doku alanının değiştirilmesine yol açar, bu da arkitektonikleri değiştirir ve böbreğin fonksiyonel yetmezliğinin derecesini arttırır. Süreç böbreğin tamamını kapsar ve büzülmesine yol açar. Eksüdadan gelen granüler siliyer kütleler önce epitel tübüllerini doldurur ve daha sonra silindirler tarafından dışarı itilir. Lifli kordonlar azalır, metanefromlar kaybolur ve aynı zamanda tübüllerdeki ve interstisyumdaki kolloid miktarı artar. Kandaki protein miktarı artar, hipoglobulinemi, makrositopoez, hiperlipidemi ve pozitif immünolojik testler ortaya çıkar. Böbreklerde bakteri yoktur veya periglomerüler bölgede az sayıda bulunur. Hastalığın başlangıcının klinik tablosu interstisyel olana benzer