Кожна із залоз, що секретує ферменти, повинна отримувати стимул для виділення свого продукту в належний час. Безперервна секреція ферментів залозами була б зайвою та навіть шкідливою. Координація виділення травних соків із присутністю їжі досягається двома способами – за допомогою нервової системи та гормонів.
Гормони являють собою хімічні речовини, що виділяються в одній частині організму і переносяться кров'ю в іншу частину, де вони мають свою специфічну дію. Функцію слинних залоз повністю регулює нервова система. Запах або смак їжі дратує нервові клітини в носовій або ротовій порожнині, змушуючи їх посилати імпульси в центр слиновиділення, що знаходиться в довгастому мозку; ці імпульси передаються слинні залози, викликаючи відділення слини.
Одна присутність у роті безсмачних, позбавлених запаху предметів, наприклад камінчиків, стимулює інші клітини слизової оболонки рота, які у такий же спосіб викликають слиновиділення. Крім того, імпульси можуть виходити від вищих центрів головного мозку: лише вид їжі або думка про неї може викликати секрецію слини. Таким чином, слинні залози реагують на хімічні, механічні та психічні стимули.
Значною частиною наших знань про механізм, що регулює секрецію шлункового соку, завдячуємо російському фізіологу І.П. Павлову, який розробив багато експериментальних методів та провів безліч тонких дослідів. Один з цих дослідів полягав у перерізанні стравоходу у собаки і виведенні двох кінців, що утворилися на поверхню шиї, так що при годівлі собаки їжа, замість того щоб потрапляти в шлунок, виходила назовні через отвір у шиї.
Хоча їжа при цьому не використовувалася, таке "уявне годування" призводило до виділення шлункового соку в кількості, що дорівнює приблизно чверті нормального. Ця чверть нормального соковиділення стимулюється нервовими імпульсами, що виникають у смакових нирках або в оці та надходять у головний мозок, звідки вони прямують до шлунка.
При перерізанні нервів, що йдуть до шлунка, соковиділення повністю вимикається. Коли їжу вкладають у ту частину перерізаного стравоходу, яка веде до шлунка, так, що собака не може бачити їжу та відчувати її запах чи смак, надходження їжі до шлунка викликає виділення приблизно половини нормальної кількості соку. Це соковиділення відбувається навіть при перерізанні нервів, що йдуть до шлунка, хоча при цьому соку виділяється менше.
Отже, соковиділення залежить частково від нервової стимуляції шлункових залоз імпульсами з клітин, що перебувають у слизовій оболонці, а частково — від дії гормону, названого гастрином. Гормон гастрин виділяється клітинами слизової оболонки пілоричного відділу шлунка щоразу, коли частково перетравлена їжа приходить у зіткнення з цими клітинами.
Існування та дія цього гормону було остаточно доведено у дослідах з перехресним кровообігом, у яких кровоносну систему одного собаки з'єднували з кровоносною системою іншої. Коли в пилоричну ділянку шлунка одного собаки вводили їжу, шлункові залози іншої починали секретувати.
Деяке виділення шлункового соку викликається присутністю їжі у кишечнику. Можливо, що це обумовлено дією амінокислот, що всмокталися в кров із тонкої кишки, а можливо, і якимось ще невідомим рефлексом чи гормоном.
Участь такої множини різних механізмів дозволяє шлунку забезпечити належну кількість соку відповідно до кількості та характеру прийнятої їжі.
Стимуляцію підшлункової залози здійснює гормон секретин, що виділяється клітинами слизової оболонки верхнього відділу тонкої кишки. У свою чергу стимулом для цих клітин є кислотність їжі, що надходить у кишечник зі шлунка. У нормальних умовах кислий хімус, що надходить у тонку кишку, стимулює клітини у її стінках, спонукаючи їх виділяти секретин у кровоносні судини кишечника. Цей гормон, що розноситься кров'ю по всьому тілу, зрештою досягає підшлункової залози та змушує її виділяти синтезовані нею ферм.