След като храната се усвои, тя трябва да се абсорбира в тялото през епитела на храносмилателния тракт. Абсорбцията се извършва главно в тънките черва, особено в долните му части. Водата се абсорбира в дебелото черво, но почти всички минерали и органични вещества се абсорбират през стената на тънките черва.
Чревната лигавица образува множество гънки; това увеличава смукателната повърхност и по този начин ускорява абсорбцията. В допълнение, вътрешната повърхност на тези гънки е покрита с безброй подобни на пръсти издатини, наречени чревни власинки, всяка от които съдържа мрежа от кръвоносни капиляри и един лимфен капиляр, преминаващ в средата. Абсорбцията е сложен процес, отчасти включващ проста дифузия на вещества от чревната кухина през епителните клетки в кръвта или лимфните капиляри.
Някои вещества се абсорбират, въпреки факта, че съдържанието им в кръвта е по-високо, отколкото в червата. Клетките, покриващи червата, трябва да вършат работата по „изпомпване“ на тези вещества в кръвта срещу градиент на концентрация. Този процес е подобен на секрецията, при която клетките също извършват работата по преместване на вещества от една област в друга.
Чревните епителни клетки образуват полупропусклива мембрана, която позволява преминаването на някои вещества, като аминокиселини и глюкоза, като същевременно предотвратява преминаването на други, като непроменени протеинови молекули и нишесте. Глюкозата и аминокиселините се абсорбират в кръвоносните капиляри и се изпращат с кръвта от порталната вена в черния дроб, откъдето впоследствие се разпределят в останалата част от тялото.
Глицеролът и мастните киселини - продукти от разграждането на мазнините - навлизат в тъканите по различен начин. Жлъчните соли играят важна роля за улесняване на усвояването на мастни киселини, моноглицериди и диглицериди (продукти от хидролиза на мазнини) и други липидоразтворими вещества, като мастноразтворими витамини. Тъй като продуктите от липидната хидролиза преминават през епителните клетки на чревните власинки, от тях се ресинтезират мастни молекули; тези молекули се натрупват в малки топчета, които навлизат в лимфните капиляри.
Съдържанието на чревните лимфни съдове в крайна сметка навлиза в големия торакален канал и оттам в кръвта, тъй като този канал се отваря в лявата брахиална вена. По този начин мазнините най-накрая навлизат в кръвния поток и се разпределят в тялото, но не по същия директен начин като захарите и аминокиселините.