Po strávení potravy se musí vstřebat do těla přes epitel trávicího traktu. K vstřebávání dochází především v tenkém střevě, zejména v jeho spodních částech. Voda se vstřebává v tlustém střevě, ale téměř všechny minerály a organické látky se vstřebávají stěnou tenkého střeva.
Střevní sliznice tvoří mnoho záhybů; tím se zvětší sací plocha a tím se urychlí vstřebávání. Vnitřní povrch těchto záhybů je navíc pokryt bezpočtem prstovitých výběžků zvaných střevní klky, z nichž každý obsahuje síť krevních kapilár a jednu lymfatickou kapiláru probíhající uprostřed. Absorpce je složitý proces, který částečně zahrnuje jednoduchou difúzi látek ze střevní dutiny přes epiteliální buňky do krevních nebo lymfatických kapilár.
Některé látky se vstřebávají i přesto, že jejich obsah v krvi je vyšší než ve střevech. Buňky lemující střevo musí vykonat práci „pumpování“ těchto látek do krve proti koncentračnímu gradientu. Tento proces je podobný sekreci, při které buňky také vykonávají práci při přesunu látek z jedné oblasti do druhé.
Buňky střevního epitelu tvoří semipermeabilní membránu, která umožňuje průchod některým látkám, jako jsou aminokyseliny a glukóza, a brání průchodu jiných, jako jsou nezměněné molekuly bílkovin a škrob. Glukóza a aminokyseliny se vstřebávají do krevních kapilár a spolu s krví portální žíly jsou posílány do jater, odkud jsou následně distribuovány do zbytku těla.
Glycerol a mastné kyseliny – produkty trávení tuků – vstupují do tkání jiným způsobem. Žlučové soli hrají důležitou roli při usnadnění vstřebávání mastných kyselin, monoglyceridů a diglyceridů (produktů hydrolýzy tuků) a dalších látek rozpustných v tucích, jako jsou vitamíny rozpustné v tucích. Když produkty hydrolýzy lipidů procházejí epiteliálními buňkami střevních klků, dochází z nich k resyntéze molekul tuku; tyto molekuly se hromadí do malých kuliček, které vstupují do lymfatických kapilár.
Obsah střevních lymfatických cév se nakonec dostává do velkého hrudního vývodu a odtud do krve, neboť tento vývod ústí do levé pažní žíly. Tímto způsobem se tuk konečně dostává do krevního oběhu a je distribuován po celém těle, ale ne tak přímou cestou jako cukry a aminokyseliny.