Μετά την πέψη της τροφής, πρέπει να απορροφηθεί στο σώμα μέσω του επιθηλίου της πεπτικής οδού. Η απορρόφηση γίνεται κυρίως στο λεπτό έντερο, ιδιαίτερα στα κατώτερα μέρη του. Το νερό απορροφάται στο παχύ έντερο, αλλά σχεδόν όλα τα μέταλλα και οι οργανικές ουσίες απορροφώνται μέσω του τοιχώματος του λεπτού εντέρου.
Ο εντερικός βλεννογόνος σχηματίζει πολλές πτυχές. Αυτό αυξάνει την επιφάνεια αναρρόφησης και ως εκ τούτου επιταχύνει την απορρόφηση. Επιπλέον, η εσωτερική επιφάνεια αυτών των πτυχών καλύπτεται με αμέτρητες προεξοχές που μοιάζουν με δάχτυλα που ονομάζονται εντερικές λάχνες, καθεμία από τις οποίες περιέχει ένα δίκτυο τριχοειδών αγγείων αίματος και ένα λεμφικό τριχοειδές που τρέχει στη μέση. Η απορρόφηση είναι μια πολύπλοκη διαδικασία, η οποία εν μέρει περιλαμβάνει απλή διάχυση ουσιών από την εντερική κοιλότητα μέσω των επιθηλιακών κυττάρων στο αίμα ή στα λεμφικά τριχοειδή αγγεία.
Ορισμένες ουσίες απορροφώνται, παρά το γεγονός ότι η περιεκτικότητά τους στο αίμα είναι υψηλότερη από ότι στα έντερα. Τα κύτταρα που καλύπτουν το έντερο πρέπει να κάνουν το έργο της «άντλησης» αυτών των ουσιών στο αίμα ενάντια σε μια κλίση συγκέντρωσης. Αυτή η διαδικασία είναι παρόμοια με την έκκριση, στην οποία τα κύτταρα κάνουν επίσης το έργο της μετακίνησης ουσιών από τη μια περιοχή στην άλλη.
Τα εντερικά επιθηλιακά κύτταρα σχηματίζουν μια ημιπερατή μεμβράνη που επιτρέπει σε ορισμένες ουσίες, όπως τα αμινοξέα και τη γλυκόζη, να περάσουν, ενώ εμποδίζει τη διέλευση άλλων, όπως τα αμετάβλητα μόρια πρωτεΐνης και το άμυλο. Η γλυκόζη και τα αμινοξέα απορροφώνται στα τριχοειδή αγγεία του αίματος και αποστέλλονται με το αίμα της πυλαίας φλέβας στο ήπαρ, από όπου στη συνέχεια διανέμονται στο υπόλοιπο σώμα.
Η γλυκερίνη και τα λιπαρά οξέα - προϊόντα της πέψης του λίπους - εισέρχονται στους ιστούς με διαφορετικό τρόπο. Τα χολικά άλατα παίζουν σημαντικό ρόλο στη διευκόλυνση της απορρόφησης λιπαρών οξέων, μονογλυκεριδίων και διγλυκεριδίων (προϊόντα υδρόλυσης λίπους) και άλλων λιποδιαλυτών ουσιών, όπως οι λιποδιαλυτές βιταμίνες. Καθώς τα προϊόντα της υδρόλυσης λιπιδίων διέρχονται από τα επιθηλιακά κύτταρα των εντερικών λαχνών, μόρια λίπους συντίθενται εκ νέου από αυτά. αυτά τα μόρια συσσωρεύονται σε μικροσκοπικές μπάλες που εισέρχονται στα λεμφικά τριχοειδή αγγεία.
Το περιεχόμενο των εντερικών λεμφικών αγγείων εισέρχεται τελικά στον μεγάλο θωρακικό πόρο και από εκεί στο αίμα, καθώς αυτός ο πόρος ανοίγει στην αριστερή βραχιόνιο φλέβα. Με αυτόν τον τρόπο, το λίπος εισέρχεται τελικά στην κυκλοφορία του αίματος και κατανέμεται σε όλο το σώμα, αλλά όχι με τον ίδιο άμεσο τρόπο όπως τα σάκχαρα και τα αμινοξέα.