Ligesom testiklerne er æggestokkene endokrine kirtler og producerer ikke kun æg til reproduktion, men udskiller også kønshormonerne østrogener og gestagen. Både æggestokke og testikler udvikler sig fra mesodermen, fra kønsryggen placeret på den ventrale side af den primære nyre. Æggestokkene er parrede bønneformede strukturer på omkring 4 cm i længden, holdt på den dorsale side af bughulen af mesenterier.
Det ydre lag af hver af disse kirtler er dannet af det germinale epitel, hvorfra æggene udvikler sig, og den indre del består af bindevæv og blodkar. Direkte under germinal epitel ligger et tykt lag af sfæriske cellulære formationer - follikler, som hver indeholder et æg. Ved fødslen er der allerede dannet flere hundrede tusinde follikler fra det germinale epitel.
Nogle af dem degenererer, men de fleste forbliver i dvale indtil puberteten, hvor vækst- og udviklingsprocessen begynder. Hver måned begynder en eller flere follikler at forstørre og blive strakt af follikelvæske, indtil de til sidst stikker ud over overfladen af æggestokken og brister og frigiver det æg, de indeholder. Denne proces kaldes ægløsning.
Det frigivne æg bevæger sig gennem en kanal kaldet æggelederen (æggelederen) ind i livmoderen. Hvis et æg møder en sædcelle og bliver befrugtet i toppen af æggelederen, vil det til sidst implanteres i livmodervæggen og begynde at udvikle sig til et embryo. Hvis befrugtningen ikke sker, degenererer ægget. Uanset om befrugtning finder sted, formerer de celler i follikelen, der er tilbage efter dens brud under ægløsning, hurtigt og fylder hulrummet på stedet for den tidligere follikel. Da disse celler er gule i farve, kaldes den resulterende formation corpus luteum. Da den er på størrelse med en ært, rager den ud over overfladen af æggestokken og er synlig for det blotte øje.
Hvis der er sket befrugtning, forbliver corpus luteum i mange måneder; ellers vil det atrofiere og blive til en lille hvid plet af arvæv efter ca. to uger. Det vigtigste kvindelige kønshormon, 17β-estradiol, produceres af cellerne, der beklæder hulrummet i hver follikel. Dette stof forårsager de fysiske ændringer, der opstår hos en kvinde under puberteten: udvidelse af bækkenet, udvikling af mælkekirtlerne, vækst af livmoderen og skeden, udseendet af kønsbehåring, ændringer i stemmens klang og begyndelsen af menstruation . Det andet kvindelige kønshormon, progesteron, produceres i cellerne i corpus luteum. Det er nødvendigt at fuldføre hver menstruationscyklus, da det fuldender de ændringer, der sker i livmoderen under påvirkning af østradiol. Derudover muliggør det implantation af et befrugtet æg i livmodervæggen og stimulerer udviklingen af mælkekirtler i de sidste måneder af graviditeten.
Kemisk er progesteron relateret til hormonerne i binyrebarken og menes at blive dannet som et mellemprodukt i deres syntese, såvel som i syntesen af østradiol og testosteron. Både mandlige og kvindelige kønshormoner produceres hos individer af begge køn; faktisk er en af de rigeste kilder til kvindeligt kønshormon, der bruges til praktiske formål, urin fra hingste. For nylig er kvindelige kønshormoner blevet fundet i palmeolie og i vævene i pilen Salix misfarves. Hvilken rolle de spiller dér er uvist.