I likhet med testiklene er eggstokkene endokrine kjertler og produserer ikke bare egg for reproduksjon, men skiller også ut kjønnshormonene østrogener og gestagen. Både eggstokker og testikler utvikles fra mesodermen, fra genitalryggen som ligger på den ventrale siden av primærnyren. Eggstokkene er sammenkoblede bønneformede strukturer omtrent 4 cm lange, holdt på ryggsiden av bukhulen av mesenterier.
Det ytre laget av hver av disse kjertlene er dannet av det germinale epitelet som eggene utvikler seg fra, og den indre delen består av bindevev og blodårer. Rett under germinal epitel ligger et tykt lag av sfæriske cellulære formasjoner - follikler, som hver inneholder et egg. Ved fødselen er det allerede flere hundre tusen follikler dannet fra germinal epitel.
Noen av dem degenererer, men de fleste forblir i dvale til puberteten, når prosessen med vekst og utvikling starter. Hver måned begynner en eller flere follikler å forstørre og bli strukket av follikulærvæske til de til slutt stikker ut over overflaten av eggstokken og sprekker, og frigjør egget de inneholder. Denne prosessen kalles eggløsning.
Det frigjorte egget beveger seg gjennom en kanal kalt egglederen (egglederen) inn i livmoren. Hvis et egg møter en sædcelle og blir befruktet på toppen av egglederen, vil det til slutt implanteres inn i livmorveggen og begynne å utvikle seg til et embryo. Hvis befruktning ikke skjer, degenererer egget. Uavhengig av om befruktning skjer, formerer cellene i follikkelen som er igjen etter brudd under eggløsning seg raskt og fyller hulrommet på stedet for den tidligere follikkelen. Siden disse cellene er gule i fargen, kalles den resulterende formasjonen corpus luteum. Ettersom den er på størrelse med en ert, stikker den ut over overflaten av eggstokken og er synlig for det blotte øye.
Hvis befruktning har skjedd, forblir corpus luteum i mange måneder; ellers vil det atrofiere og bli til en liten hvit flekk av arrvev etter omtrent to uker. Det viktigste kvinnelige kjønnshormonet, 17β-østradiol, produseres av cellene i hulrommet i hver follikkel. Dette stoffet forårsaker de fysiske endringene som oppstår hos en kvinne under puberteten: utvidelse av bekkenet, utvikling av brystkjertlene, vekst av livmoren og skjeden, utseendet av kjønnshår, endringer i stemmens klang og begynnelsen av menstruasjonen . Det andre kvinnelige kjønnshormonet, progesteron, produseres i cellene i corpus luteum. Det er nødvendig å fullføre hver menstruasjonssyklus, da den fullfører endringene som skjer i livmoren under påvirkning av østradiol. I tillegg gjør det det mulig for et befruktet egg å implantere seg i livmorveggen og stimulerer utviklingen av brystkjertler i de siste månedene av svangerskapet.
Kjemisk er progesteron relatert til hormonene i binyrebarken og antas å dannes som et mellomprodukt i deres syntese, så vel som i syntesen av østradiol og testosteron. Både mannlige og kvinnelige kjønnshormoner produseres hos individer av begge kjønn; faktisk er en av de rikeste kildene til kvinnelig kjønnshormon brukt til praktiske formål urinen fra hingster. Nylig har kvinnelige kjønnshormoner blitt funnet i palmeolje og i vevet til pilen Salix misfarges. Hvilken rolle de spiller der er ukjent.