Autolýza je proces destrukce buněk a uvolňování biologicky aktivních látek z nich. V důsledku autolýzy se do buňky dostávají živiny a buňka je trávena. Dochází k syntéze nezbytných enzymů nezbytných pro trávení vlastních struktur a tkání. Rozklad komplexních sloučenin na jednodušší se nazývá autolýza. Destrukce strukturních prvků buněk vede k uvolňování látek, které jsou nezbytné pro syntézu nových. Říká se jim autoenzymy.
Autolýza je nezbytná pro normální fungování těla a udržení jeho životních funkcí.
V přírodě se procesy autolýzy vyskytují u většiny živých organismů, ale nejvíce jsou vyvinuty u rostlin a hub. Autolýza také označuje krájení potravy v lidském žaludku, kde žaludeční enzymy štěpí bílkoviny potravy na aminokyseliny. Tento proces zajišťuje, že tělo vstřebává bílkoviny.