Gli apofermen sono enzimi a struttura aperta, cioè non contengono zinco, calcio e magnesio.
Gli apoenzimi sono enzimi immaturi (o non attivati) che si formano a seguito dell'autolisi cellulare (lisi) e durante la traduzione. Gli apoenzimi passano liberamente il substrato attraverso i monomeri della molecola attraverso un ampio spazio, mentre l'enzima di questo spazio impedisce la penetrazione nel substrato, l'interazione avviene attraverso un legame stereospecifico
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