La batteriologia alimentare (batteriologia sanitario-nutrizionale) è la scienza delle leggi più generali della flora saprofita dei prodotti alimentari legate al loro valore nutrizionale e alla risposta fisiologica generale nell'uomo. Questa scienza studia i microrganismi pericolosi per la vita umana e animale contenuti in numerosi tipi di materie prime alimentari. Il compito principale dell'esame batteriologico delle materie prime alimentari è determinare la presenza di microrganismi in esso, il loro numero, nonché determinare se questi microrganismi appartengono a specie e gruppi indicativi sanitari o patogeni. L'esecuzione dell'esame batteriologico è di grande importanza per migliorare la qualità dei prodotti alimentari. L'esame batteriologico delle materie prime alimentari, dei semilavorati e dei prodotti alimentari finiti deve essere effettuato secondo determinate regole, osservando il sistema di controllo di qualità accettato, con una rigorosa differenziazione degli oggetti di ricerca in base alla gradazione del rischio di infezione da parte della loro microflora . Un approccio così differenziato al monitoraggio dello stato di salute dei prodotti consente di aumentare l'accuratezza della ricerca e ridurre al minimo il numero di scarti di prodotti errati e di difetti di fabbricazione.