A bacteriologia alimentar (bacteriologia sanitário-nutricional) é a ciência das leis mais gerais da flora saprófita dos produtos alimentares relacionadas com o seu valor nutricional e a resposta fisiológica geral no ser humano. Esta ciência estuda microrganismos perigosos para a vida humana e animal contidos em vários tipos de matérias-primas alimentares. A principal tarefa do exame bacteriológico de matérias-primas alimentares é determinar a presença de microrganismos nas mesmas, seu número, bem como determinar se esses microrganismos pertencem a espécies e grupos indicativos sanitários ou patogênicos. A realização de exames bacteriológicos é de grande importância para a melhoria da qualidade dos produtos alimentícios. O exame bacteriológico de matérias-primas alimentares, produtos semiacabados e produtos alimentícios acabados deve ser realizado de acordo com certas regras, observando o sistema de controle de qualidade aceito, com diferenciação estrita dos objetos de pesquisa de acordo com a gradação do risco de infecção por sua microflora . Essa abordagem diferenciada no monitoramento da saúde dos produtos permite aumentar a precisão das pesquisas e reduzir ao mínimo o número de rejeições incorretas de produtos e defeitos de fabricação.