Fødevarebakteriologi (sanitær-ernæringsbakteriologi) er videnskaben om de mest generelle love for den saprofytiske flora af fødevarer relateret til deres ernæringsmæssige værdi og generelle fysiologiske respons hos mennesker. Denne videnskab studerer mikroorganismer, der er farlige for menneskers og dyreliv, der er indeholdt i adskillige typer fødevarer råvarer. Hovedopgaven med bakteriologisk undersøgelse af fødevareråvarer er at bestemme tilstedeværelsen af mikroorganismer i det, deres antal, samt at bestemme, om disse mikroorganismer tilhører sanitære indikative eller patogene arter og grupper. Gennemførelse af bakteriologisk undersøgelse er af stor betydning for at forbedre kvaliteten af fødevarer. Bakteriologisk undersøgelse af fødevareråvarer, halvfabrikata og færdige fødevarer skal udføres i overensstemmelse med visse regler under overholdelse af det accepterede kvalitetskontrolsystem, med streng differentiering af forskningsobjekter i henhold til gradueringen af risikoen for infektion af deres mikroflora . En sådan differentieret tilgang til overvågning af produkters sundhed gør det muligt at øge nøjagtigheden af forskningen og reducere antallet af forkerte produktafvisninger og fabrikationsfejl til et minimum.