Pepsin mədə mukozasının əsas hüceyrələri tərəfindən ifraz olunan proteolitik fermentdir. Zülalları peptidlərə və amin turşularına parçalayır, bu da qidanın daha da həzm edilməsi və udulması üçün lazımdır.
Pepsin yalnız mədənin asidik mühitində aktivdir və təxminən 2 pH-da optimal təsir göstərir. Mədədə belə aşağı turşuluq onun selikli qişasının parietal hüceyrələri tərəfindən istehsal olunan xlorid turşusu tərəfindən yaradılır. PH 5-dən yuxarı qalxdıqda, pepsin fəaliyyətini itirir.
Beləliklə, pepsin mədə şirəsinin əsas fermentlərindən biri olmaqla zülallı qidaların həzmində mühüm rol oynayır. Mədənin turşu mühitində onun optimal fəaliyyəti həzm prosesinin ilkin mərhələlərində zülalların effektiv hidrolizini təmin edir.